在运行 RStudio 的守护进程 Docker 中使用 ENV 变量

Question

我可以使用默认的 ENV 变量设置 Dockerfile，然后我可以在运行我的 docker 容器时配置这些变量，例如在 Dockerfile 中，我有以下几行：

ENV USERNAME ropensci
ENV EMAIL ropensci@github.com
RUN git config --global user.name $USERNAME
RUN git config --global user.email $EMAIL

太好了。当我启动交互式会话时：

docker run -it --env USERNAME="Carl" --env EMAIL=cboettig@example.com myimage /bin/bash

然后我可以发出命令git config --list 并看到 git 被配置为使用我在命令行上提供的值而不是默认值。

但是，我的Dockerfile 也被配置为运行 RStudio 服务器，然后我可以在以守护程序模式运行图像时登录浏览器：

docker run -d -p 8787:8787 --env USERNAME="Carl" --env EMAIL=cboettig@example.com cboettig/ropensci-docker

我去 localhost:8787 并登录到 RStudio，一切都按预期工作，启动一个启用了 git 的新“项目”，但是 RStudio 找不到我的 git 名称和电子邮件。我可以从 RStudio 菜单中打开 shell 并运行 git config --list 或 echo $USERNAME，我只得到一个空白值。为什么这适用于 /bin/bash 但不适用于 RStudio，我该如何解决？

Answer 1

您的 git 配置设置在 /.gitconfig 上。此配置文件适用于 root 用户。您需要为 rstudio 用户设置 git config，因为 rstudio 在 rstudio 用户上运行。下面的命令是一个临时解决方案。

docker run -it -p 8787:8787 --env USERNAME="Carl" --env EMAIL=cboettig@example.com cboettig/ropensci-docker bash -c "cp /.gitconfig /home/rstudio; /usr/bin/supervisord"

有效！

另一种解决方案是基于 cboettig/ropensci-docker 编写 Dockerfile。以下是示例 Dockerfile。

FROM cboettig/ropensci-docker
RUN cp /.gitconfig /home/rstudio
CMD ["/usr/bin/supervisord"]