如何为 R CMD 检查设置 testthat？

Question

显然有两种方法可以将testthat 与R CMD check 集成。我也不能上班。

方法 #1：（可能已弃用）

根据devtools wiki：

在开发包时，将测试放在 inst/tests 中，然后 创建一个文件tests/run-all.R（注意它必须是大写的R）， 其中包含以下代码：

library(testthat) 
library(mypackage)
test_package("mypackage") 

这将评估您在包中的测试 命名空间（所以你可以测试非导出的函数），它会抛出 如果有任何测试失败，则会出现错误。这意味着您将看到 测试失败的完整报告和 R CMD 检查不会通过，除非全部 测试通过。

整个包是here。其中有两个文件：

## minimalbugexample/inst/tests/run-all.R
library(testthat)
library(minimalbugexample)
test_package('minimalbugexample')

和

## minimalbugexample/inst/tests/test-use-Matrix-package.R
context("Intentional break")
  expect_that( TRUE, equals(FALSE))

我的描述是

Package: minimalbugexample
Title: 
Description: 
Version: 0.1.1
Author: Nathan VanHoudnos <nathanvan@letterafterFmail.com>
Maintainer: Nathan VanHoudnos <nathanvan@letterafterFmail.com>
Depends:
    R (>= 3.0.1),
    Matrix (>= 1.0)
Suggests:
    testthat
License: GPL
LazyData: true
Collate:
    'minimalbugexample-package.r'
    'use-Matrix-package.R'

安装软件包后，我可以很好地运行测试（它们失败了，正如预期的那样）。

> test_package('minimalbugexample')
Intentional break : 1


1. Failure:  -------------------------------------------------------------------
TRUE not equal to FALSE
1 element mismatch
Error: Test failures
> 

但是R CMD check 不会运行测试。

$ R CMD check minimalbugexample_0.1.1.tar.gz 
... snip ...
* checking PDF version of manual ... WARNING
WARNING: There was 1 warning.
See
  ‘/home/nathanvan/software/minimalbugexample.Rcheck/00check.log’
for details.

我认为 PDF 警告与此无关，但如果需要，我可以提供更多详细信息。

方法#2：（出血边缘）

根据README file of the testthat repository：

现在，推荐的做法是将您的测试放在 tests/testthat 中，并且 确保 R CMD 检查运行然后通过将以下代码放入 测试/test-all.R：

library(testthat)
test_check(yourpackage)

所以我确保我安装了最新版本的 testthat：

> install_github("testthat")

然后换了包。你可以得到这个版本here。我将这两个文件修改为

## minimalbugexample/inst/tests/test-all.R
library(testthat)
test_check(minimalbugexample)

和

## minimalbugexample/inst/tests/testthat/test-use-Matrix-package.R
context("Intentional break")
  expect_that( TRUE, equals(FALSE))

然后将DESCRIPTION文件中的包版本更新为0.1.2，我可以构建它，安装它，并使用testthat检查它并获得与以前相同的输出。因此，就testthat 而言，它似乎在工作。

但是，R CMD check 仍然没有运行测试：

$ R CMD check minimalbugexample_0.1.2.tar.gz 
... snip ...
* checking PDF version of manual ... WARNING
LaTeX errors when creating PDF version.
This typically indicates Rd problems.
WARNING: There was 1 warning.
See
  ‘/home/nathanvan/software/minimalbugexample.Rcheck/00check.log’
for details.

所以问题：

我做错了什么？我更喜欢方法 2 的解决方案，但我会采取任何一种方法！

Answer 1

您没有tests 目录。 test-all.R 应位于 minimalbugexample/tests/test-all.R。

然后你的实际测试进入minimalbugexample/inst/tests 用于方法#1 或minimalbugexample/tests/testthat/ 用于方法#2。

对于方法#2，test-all.R 文件应使用test_check(yourpackage) 而不是test_package(yourpackage)，并且不再需要library(yourpackage) 调用。