GGplot Barplot 不接受 Y 值？答案

【问题标题】：GGplot Barplot does not accept Y value?GGplot Barplot 不接受 Y 值？
【发布时间】：2013-10-23 18:27:17
【问题描述】：

我有一个数据框：

>picard
count    reads
 1    20681318
 2     3206677
 3      674351
 4      319173
 5      139411
 6      117706

如何在 ggplot（条形图）上绘制 log10（计数）与 log10（读取）？

我试过了：

ggplot(picard) + geom_bar(aes(x=log10(count),y=log10(reads)))

但它不接受 y=log10(reads)。如何绘制我的 y 值？

【问题讨论】：

标签： r ggplot2 bar-chart

【解决方案1】：

使用stat="identity":

ggplot(picard) + geom_bar(aes(x=log10(count),y=log10(reads)), stat="identity")

您的方法实际上会收到警告：

将变量映射到 y 并使用 stat="bin"。使用 stat="bin"，它将尝试将 y 值设置为每组中的案例数。这可能会导致意外行为，并且不会在未来版本的 ggplot2 中被允许。如果您希望 y 表示案例计数，请使用 stat="bin" 并且不要将变量映射到 y。如果您希望 y 表示数据中的值，请使用 stat="identity"。有关示例，请参见 ?geom_bar。（已弃用；最后在 0.9.2 版本中使用）

【讨论】：

【解决方案2】：

你可以做这样的事情，但是用 log10 比例绘制不连续的 x 轴对我来说没有意义：

ggplot(picard) +
    geom_bar(aes(x=count,y=reads),stat="identity") +
    scale_y_log10() +
    scale_x_log10()

如果您只想要一个具有 log10 比例的 y 轴，只需这样做：

ggplot(picard) +
    geom_bar(aes(x=count,y=reads),stat="identity") +
    scale_y_log10()

【讨论】：

有没有办法增加条的宽度？
@user2703967 是的，使用geom_bar() 的width 参数。
由于数据的关系，图表非常交错。我可以使用 geom_density() 来绘制这些值吗？我可能需要设置自己的密度，但我不知道该怎么做。
@user2703967，在人们开始花时间帮助您之前，请仔细考虑您真正希望实现的目标。密度图与条形图完全不同。
问题是，由于数据如此多样，条形图非常交错。这就是为什么我想绘制一个密度图，以便它给我一条平滑的线，但基本上形状与条形图相同。

【解决方案3】：

有一种直接的方法可以做到这一点，即使用 geom_col() 函数。只需对您的代码进行微小的调整：

ggplot(picard) + geom_col(aes(x=log10(count), y=log10(reads)))

它会给出与将stat 参数设置为identity 和geom_bar() 相同的输出。问题是，geom_bar() 使用 count 作为 stat 的默认值，因此它不会为 y 轴使用任何变量。它将简单地使用计数，即 x 轴的每个值的出现次数，因为它是 y 轴。我希望这能回答你的问题。

【讨论】：