在 Rstudio 中运行 python/bash 代码答案

【问题标题】：Running python/bash code in Rstudio在 Rstudio 中运行 python/bash 代码
【发布时间】：2016-03-19 17:19:17
【问题描述】：

我将 Rstudio 用于我的日常 R 内容。有时，我想对 R 不太擅长的部分使用一些 python/bash。奇怪的是，我注意到如果我开始一个新的 RMarkdown 文档，以下代码可以工作：

```{r engine='python'}
print "Hello" + "World"
import random
print random.random()
```

Rstudio 可以运行一些 python。这非常有用，但最好我不仅可以通过降价功能运行它，还可以通过控制台运行它。在release notes 中建议支持语法高亮。

我想知道，是否有任何方法可以将新控制台连接到 Rstudio，以便我们也可以从 IDE 执行一些 python/bash？看起来 Rstudio 似乎有一个如何连接到 python 的概念。最终目标是创建 .Rmd 文档并能够编辑/交互具有以下结构的文档：

# Use Case 

Connect to an api that is supported in python

```{r engine='python', highlight=TRUE}
data = foobar_api.get(1000)
file_loc = open("~/data/filename.csv", "w")
file_loc(data) 
file_loc.close()
```

Then analyse with R again. 

```{r}
df <- read.csv("~/data/filename.csv")
summary(df)
```

【问题讨论】：

标签： python r bash rstudio

【解决方案1】：

首先您需要设置knitr 选项。

```{r}
knitr::opts_chunk$set(engine.path = list(python = '/anaconda/bin/python'))
```

从那时起，它就可以工作了。

```{python}
import this 
```

【讨论】：

【解决方案2】：

这是最好的 knitr 示例，它允许multiple language engines。您可能会考虑在 VIM 中针对这些情况编辑文件，因为您可以做一些与您所要求的内容接近的有趣事情：选择文本，然后键入：

:'<,'>!python

在python中执行和

:<','>!R --no-save

要在 R 中执行。有关详细信息，请参阅this question 的答案。

上述并没有完全解决用例，因为选择的文本被命令的输出替换（在简单的 R 命令的情况下，从 R 版本等开始）。但是，可以使用this vimtip 将输出发送到不同的缓冲区（读取：窗口）。

RStudio 中的 VIM 模式非常出色（它甚至支持可视块模式）。但它不能模拟一切，RStudio 中的:!python 将不起作用。我经常在 RStudio 和 VIM 中打开我正在处理的文档，以上可能是您对混合语言的 Rmd 文档执行相同操作的原因。

【讨论】：

【解决方案3】：

如果您将Architect 或普通Eclipse 与StatET 一起使用，您可以安装PyDev 插件并启动Python 控制台并与之交互，就像您使用R 控制台一样容易（并且，还有当然是对编辑和处理 .Rmd 文件的充分支持）

【讨论】：

是否来自同一个文件？