R 噩梦：优胜美地、R、RStudio 和 Homebrew

Question

我使用装有 OS X Yosemite 10.10.2 的 MacBook Pro 13" Retina（2013 年末）。我不希望这是我最大的敌人。也许吧。

按时间顺序排列的噩梦：

1. 从官方网站下载了 R 和 RStudio。
2. 两个应用都运行了几次，很好。
3. 已安装 Homebrew。在终端运行“酿造医生”。 Brew Doctor 说 R 文件有问题。
4. RStudio 开始表现得很奇怪。
5. 通过 CRAN 镜像下载了 ggplot2 R 包。 5GB 的数据堵塞了“private/var”文件。删除了里面的一些数据。
6. Mac 吓坏了。内核恐慌，直到 Apple Store Genius 清除了 Mac 并重新安装了 OS X。

我想继续使用 R 和 RStudio。问题：

1. 如何在不再次炸毁 Mac 的情况下解决这个问题？
2. 如何通过 Homebrew 安装 R 和 RStudio？
3. 我需要先安装 XQuartz 吗？
4. 如果我安装未编译的 R 和 RStudio，会发生什么情况？
5. 我应该认识到 R、RStudio 和 Homebrew 之间的哪些冲突？
6. 安装所有 Homebrew、R 和 RStudio 的常见问题？
7. 如何让 Homebrew、R 和 RStudio 从此过上幸福的生活而不烧毁房子？

谢谢！

Answer 1

如何在不再次炸毁 Mac 的情况下解决这个问题？

不要在计算机运行时尝试删除交换文件！如果您开始删除随机系统文件，您将有一个糟糕的一天。

如何通过 Homebrew 安装 R 和 RStudio？

您可以使用brew install r 安装 R。您可以使用 homebrew-cask 安装二进制 RStudio，例如 brew install Caskroom/cask/rstudio。

我需要先安装 XQuartz 吗？

不，这应该不再需要了。

如果我安装未编译的 R 和 RStudio，会发生什么？

没什么不好的； brew doctor 可能会报告结果，但这些不是错误，您不应该认为它们代表问题，尽管如果您稍后寻求帮助尝试诊断构建失败，它们对像我这样的维护人员很有帮助。

我应该认识到 R、RStudio 和 Homebrew 之间的哪些冲突？

没有重要的冲突。如果您从http://r.research.att.com/libs/ 安装编译器（如果您使用的是 brewed R，则这是不必要的），您以后可能会遇到从 Homebrew 安装 gcc（提供 gfortran）之类的问题。

安装所有 Homebrew、R 和 RStudio 的常见问题？

自 2015 年 8 月起，不再需要以下 cmets；软件包现在默认安装到 /usr/local/lib/R/x.y/site-library，并且应该能够在 R 的小升级中继续存在。

如果您使用的是 brewed R 并且您希望您安装的软件包能够在较小的 R 升级中存活，您可以运行 mkdir -p ~/Library/R/3.2/library 然后 R 将默认将软件包安装到该路径（将软件包放在您的主目录中，而不是在地窖里）。

我怎样才能让 Homebrew、R 和 RStudio 从此过上幸福的生活而不烧毁房子？

见上文！

Answer 2

回顾这个问题，考虑所有有用的 cmets 和答案，关于在已安装 R 和 Homebrew 的 Mac 上下载 R 包：

在 RStudio 界面的 R 控制台中执行此操作，只需键入 install.packages("name of the package")

自从我开始直接在 RStudio 中下载 R 包以来，我没有遇到任何问题。系统很开心。