在 RStudio 中运行 cron 作业答案

【问题标题】：Run cron job within RStudio在 RStudio 中运行 cron 作业
【发布时间】：2018-12-09 09:45:56
【问题描述】：

我正在尝试通过 RStudio 在 EC2 实例上安排一个 cron 作业。
当我使用具有非常基本功能的基本脚本时，它可以正常工作。但是，当我想安排一个包含特定 R 包中的 R 函数的脚本时，脚本会失败。

我的 cron 看起来像这样：

MAILTO="myemail@adress.com"
36 * * * * /home/user1/Test_for_Cron.R

脚本启动后，我收到一封来自 Cron Daemon 的电子邮件，其中指定了以下内容：

R_function 中的错误：找不到函数 R_function
执行停止

根据我的发现，我似乎必须指定我想在 RStudio 中运行脚本，或者我想“获取”它。
我觉得答案可能在下面这 3 篇文章的组合中，但在测试了一些建议后我没有找到解决方案：

帮助非常感谢！

【问题讨论】：

也许可以尝试通过打印 Sys.info() 来启动脚本，以检查 cron 是否找到了正确的 R 二进制文件（和库）——我有类似这个问题的问题 + 问题是 cron 找到了错误的R的版本
当我执行 sys.info() 时，我看不到任何关于 R 库的信息
哎呀，试试.libPaths() 和R.version -- 会有相关信息

【解决方案1】：

您误解了 cron 和 shell 命令的工作原理 - R 文件不可执行（除非您对其进行更改，请参见下文）。

但是如果你只是在前面加上 Rscript 你可以 1.在你的shell中测试它直到它工作 2. 由cron 执行，这样做

36 * * * * Rscript /home/user1/Test_for_Cron.R

编辑：如果你做两件事，你可以让它可执行：

【讨论】：

【解决方案2】：

谢谢德克。是的，我确实已经在我的脚本中添加了#!/usr/bin/Rscript。问题实际上来自一个简单的事实，即我的脚本中没有加载一些库，导致错误并停止脚本。现在所有的库都已加载，一切正常！

【讨论】：