调试 R 中加载的 Rcpp 编译代码（在 OS X Mavericks 上）的有效方法是什么？

Question

调试加载到 R 中的共享对象（尤其是在 OS X Mavericks 上）的最高效、最快捷的方法是什么？我主要对调试已编译的 Rcpp 代码感兴趣。

我已经阅读了关于调试编译代码 (http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Debugging-compiled-code) 的 R 外部文档，该代码支持使用 gdb，但 Mavericks 并未正式支持 gdb。但是，lldb 似乎是一个可行的选择？从 Dirk 对这篇文章的回复（感谢 Dirk！）（Debugging (line by line) of Rcpp-generated DLL under Windows）中，我找到了解决如何在 R 中调试编译代码的最有用的资源。

按照我在下面明确概述的步骤，我可以成功调试已编译的 Rcpp 代码，其他 Rcpp 新手可能会觉得这很有用（抱歉篇幅太长，但我认为清楚比省略和模糊的）。但是这个开发过程有点乏味和耗时。

问题：

1. 与我在下面的操作相比，是否有更快和/或更简单的方法来调试已编译的 Rcpp 代码？

2. 我是 Rstudio 的忠实粉丝，并且很想将调试从该 IDE 创建的共享对象结合起来，所以如果有人知道如何做到这一点，我有兴趣知道吗？ Rstudio似乎使用了属性，而且看起来下面的第4步需要修改，因为编译后的临时目录中似乎没有.cpp文件（在我下面的示例中，没有“file5156292c0b48.cpp”文件）

步骤：

1) （一次性）转到目录 ~/.R（带有 . 的隐藏目录）。创建一个名为“Makevars”的新文件，并在其中添加行CXXFLAGS=-g -O0 -Wall。

2) 在终端中，键入R -d lldb 以启动 R。lldb 现在将启动。

3) 在 lldb 命令行中输入 run。这将启动 R。

4) 编译 Rcpp 代码并找到编译对象的位置。 Dirk 对上述帖子的回应显示了一种方法。这是我将在此处使用的示例。在 R 中运行以下命令：

library(inline)

fun <- cxxfunction(signature(), plugin="Rcpp", verbose=TRUE, body='
int theAnswer = 1;
int theAnswer2 = 2;
int theAnswer3 = 3;
double theAnswer4 = 4.5;
return wrap(theAnswer4);
')

这将创建一个已编译的共享对象和其他文件，可以通过在 R 中运行 setwd(tempdir()) 和 list.files() 来找到它们。将会有一个 .cpp 文件，例如“file5156292c0b48.cpp”和 .so像“file5156292c0b48.so”这样的文件

5) 通过在 R 命令行运行 dyn.load("file5156292c0b48.so") 将共享对象加载到 R 中

6) 现在我们要调试这个 .so 对象中的 C++ 代码。通过点击ctrl + c 返回 lldb。现在我想在 file5156292c0b48.cpp 文件的特定行设置一个断点。我通过打开另一个终端并查看 file5156292c0b48.cpp 中感兴趣的行号来找到正确的行号。假设是第 31 行，对应于 int theAnswer = 1;在我的例子中。然后我在 lldb 命令行中输入：breakpoint set -f file5156292c0b48.cpp -l 31。调试器会打印出断点已设置以及其他一些内容...

7) 通过在 lldb 中运行 cont 返回 R（在我按 Enter 之前，R 提示不会自动出现）并调用该函数。在 R 命令行中运行 fun()。现在我正在调试共享对象（按 n 转到下一行，按 p [对象名称] 打印变量等）....

Answer 1

要像这样调试简单的 Rcpp 脚本，您可以做的一件事是创建一个嵌入 R 的 .cpp 应用程序（带有 main）。这样您可以直接使用 Xcode 调试它，这将为您提供良好的调试体验。

当您开始想要调试包时，它会变得更加复杂。

Answer 2

这很难。我用一个独立的 C++ 应用程序尝试了 Xcode 和 Eclipse，但是让所有的头文件和库都工作起来非常困难。此外，RcppExport 代码通过一个指针调用你真正的 R 函数，这似乎真的让 Xcode 感到困惑，我无法进入我的函数。

我最终得到了（gdb 或 lldb）： 在 R 中： R -d lldb 在调试器中，设置断点： b functionName run 在 R 中： .Call(etc) # or just call your R code which invokes compiled C/C++ code 然后在发生中断后返回调试器，您可以单步执行、检查帧等。

这个 lldb/gdb command quick reference 帮了大忙。

现在忘记尝试在 GUI 中执行此操作。希望 Rstudio 能做到这一点。