在 .Renviron 中创建用户库目录的最佳方法是什么？答案

【问题标题】：What is the best way to create the user library directory set in .Renviron?在 .Renviron 中创建用户库目录的最佳方法是什么？
【发布时间】：2019-12-16 03:51:25
【问题描述】：

我正在努力寻找为我的团队设置 R 的最佳方式。因为我们的机构在网络共享上拥有用户主目录，所以 R 用户库默认为此网络共享。经过一番研究，我发现在 .Renviron 文件中设置 R_LIBS_USER 是最有用的（如rstudio forums 中所述）如同一篇文章所述，安装新版本的 R 后它不会自动创建此目录，因此 .libPaths() 默认为 C:/Program Files/R/../.. （忽略 R_LIBS_USER）

在下面的问题中，同样的问题是在 6 年前提出的。接受的答案没有帮助，因为它建议制作一个与版本无关的用户库。我不想在我的库中使用这些旧包。 Why do I have to create the directory "~/R/%p-library/%v" by hand on each R upgrade?

我也尝试在 .Rprofile 中设置 .libPaths，但使用 .Renviron 文件感觉更高效，所以我更喜欢使用它。这也允许用户在他们的项目中使用他们自己的 .Rprofile 设置。

我目前的工作方式是：

.Renviron 文件R_LIBS_USER=C:/Users/[user]/R/%p-library/%v
每个用户在新的 R 安装后调用这个命令dir.create(Sys.getenv('R_LIBS_USER'), recursive = TRUE)

我想知道自动创建 R_LIBS_USER 文件夹的最佳/最干净的设置是什么，因此重新安装 R 不需要任何可能被用户忘记的手动操作。

【问题讨论】：

使用Rprofile文件有什么问题？这是我们为我们的团队做的最简单的方法，我们只需输入.libPaths("C:/R/R-3.6.1/library")
这并不能解决我的问题，因为当目录不存在时，它也不会创建目录。我希望路径是动态的（带有版本号）。链接的问题说在 rprofile 中使用 dir.create() 不是最佳实践。我想知道是什么。
是的，这很有意义。

标签： r library-path r-environment

【解决方案1】：

您可以在安装 R 之后编写一个小的 powershell 脚本来运行，该脚本将创建您喜欢的任何目录/文件。可以在here 找到一个简单的示例 - 只需调整代码以包含您喜欢的任何环境变量。

一个简单的例子

将以下代码行放在一个文本文件中，并使用.ps1 文件扩展名保存它（或者如果你想测试它，只需将代码直接复制/粘贴到 powershell 提示符中）。

Add-Content c:\Users\$env:USERNAME\Documents\.Renviron "TEST_VARIABLE_1=my_username"

上面的代码行将在指定的目录中创建一个名为.Renviron 的文件，并将环境变量TEST_VARIABLE 附加到该文件中（因此它以标准方式通过.Renviron 加载到R 中）。

显然，您可以以相同的方式添加尽可能多的变量（只需复制代码行以包含您喜欢的任何环境变量）。

您还可以轻松地将.Renviron 文件的位置调整为您想要的任何位置，包括网络驱动器。

还请注意，您可以轻松地在 powershell 中创建目录（而不是文件）like so

例如

New-Item -ItemType directory -Path C:\Scripts\newDir

【讨论】：

您好，谢谢。安装（运行脚本）后仍然需要手动操作。我的问题是每个用户都应该在安装新的 R 版本后运行它。我现在这样做的方法是要求用户在 R 中运行它：dir.create(Sys.getenv('R_LIBS_USER'), recursive = TRUE) 我正在寻找一种自动方法来识别该文件夹不存在（可能在 R 启动时），并在需要时创建它。
@Jelger 我明白了。我认为除了安装 R 以创建目录之外，您总是需要做一些事情（因此您当前的解决方案可能已经尽可能自动化）。如果您想一次性完成 R 安装和创建目录，您可以使用powershell script to install R，并在该脚本的末尾添加一行来创建所需的目录。我怀疑在安装 R 版本时创建目录就足够了？