如何在 R markdown 中将当前文件位置设置为工作目录？答案

【问题标题】：How to set current file location as work directory in R markdown?如何在 R markdown 中将当前文件位置设置为工作目录？
【发布时间】：2017-11-16 05:02:24
【问题描述】：

我有mydata.RDATA要在R中使用，然后我需要load()，这意味着我需要先setwd()当前目录。我已经知道how to do it in R。

当我在 R markdown 中这样做时：

{r echo=FALSE} dirname(parent.frame(2)$ofile) script.dir <- dirname(sys.frame(1)$ofile) setwd(script.dir)

我得到如下错误：

Error in dirname(parent.frame(2)$ofile) : a character vector argument expected calls :<Anonymous>...

【问题讨论】：

我真的推荐使用 RStudio 项目和相对路径。我还在一些遗留代码中使用ofile 方法，但它非常不可靠，具体取决于文件的来源、编织等。
我用的是Rstudio，但从来没有用过project。我有500+个project，那么我只能在每个文件夹中存储.Rdata文件。
是的，你只需要打开项目文件，然后自动设置工作目录，并打开你上次在这个项目中打开的文件。

标签： r r-markdown

【解决方案1】：

如果您的 .Rmd 文件位于子文件夹中，您需要指定 knitr 的根目录，甚至如果您已使用 setwd() 甚至是 RSudio 项目指定了工作目录。

幸运的是，这就像在您的 .Rmd 文件的开头添加以下块一样简单，就在 YAML 之后：

{r "setup", include=FALSE} require("knitr") opts_knit$set(root.dir = "~/path/to/project")

~/ 是您在 Linux（也可能是 Mac）上的 HOME 目录。如果您使用的是 Windows，则必须对此进行调整。

【讨论】：

我只是不想输入'/path/to/project'，因为移动.rmd文件时不灵活。
为什么在块头中放什么很重要？如果被称为“设置”，knitr 会以不同的方式对待一个块吗？