自动化 RStudio 处理 RMarkdown？

【问题标题】：Automate RStudio processed RMarkdown?自动化 RStudio 处理 RMarkdown？
【发布时间】：2014-12-04 21:04:33
【问题描述】：

我有一个 RMarkdown 文件，用于生成漂亮的 HTML 报告。问题是，我希望能够自动化它，以便它可以在无头服务器上运行。因此，没有人在那里启动 Rstudio 并按下“knithtml”按钮，似乎 Rstudio 正在做很多额外的魔法，比如拥有自己的 pandoc 版本、运行所有必要的命令、应用 css 样式等。

如何获取此报告并生成与我按下“knithtml”按钮时 Rstudio 生成的内容相同的内容，但只需运行 R 脚本？

谢谢。

【问题讨论】：

标签： r knitr rstudio pandoc r-markdown

【解决方案1】：

尝试使用

rmarkdown::render("/PATH/TO/YOUR.Rmd", output_file="/PATH/TO/YOUR/OUTPUT.html")

相反。这假设您已经在无头盒子上加载了 rmarkdown 库。它将使用系统 pandoc，但请确保它是 1.12 或更高版本。

knit2html 的作用如下（通过“控制台”附近的“R Markdown”选项卡）：

这是一个并排的。左边是点击按钮，右边是运行命令：

【讨论】：

【解决方案2】：

我有同样的问题。经过一番蛮力，我用这个命令行得到了与 RStudio 相同的结果：

"path\to\Rscript.exe" -e "rmarkdown::find_pandoc(dir='path/to/RStudio/bin/pandoc'); rmarkdown::render('file.Rmd')"

【讨论】：