在 mac El Capitan 上安装和加载 rJava 时遇到问题答案

【问题标题】：trouble installing and loading rJava on mac El Capitan在 mac El Capitan 上安装和加载 rJava 时遇到问题
【发布时间】：2017-10-20 05:51:06
【问题描述】：

在安装 rJava 时遇到问题，尝试了大多数故障排除步骤 here 并且不起作用。

返回错误

Loading required package: rJava
Error: package or namespace load failed for 'rJava':
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
 call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object     '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/    rJava.so':

我正在使用最新版本的 R/Rstudio 和 Mac El Capitan

我也试过这个方法1，没用

sudo R CMD javareconf

然后，在 R 解释器中：

install.packages('rJava', type='source')
install.packages('xlsx', type='source')

方法二

sudo ln -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib

错误返回 ln: /usr/local/lib/libjvm.dylib: 文件存在

方法 3 install.packages("rJava", type = "binary") 错误：tar：无法设置默认语言环境

处理默认语言环境错误

system("defaults write org.R-project.R force.LANG en_US.UTF-8")

在加载 rJava 时，还是同样的错误：

image not found

所以看起来它已经安装但不会加载

【问题讨论】：

SO 线程比那个多得多：stackoverflow.com/…
感谢您的回复，我实际上尝试了很多，目前没有任何效果
我刚刚写了一个简短的说明，希望对您有所帮助：zhiyzuo.github.io/installation-rJava

标签： r installation rjava

【解决方案1】：

我也遇到了很多麻烦，最终发现以下 SO 线程是最相关的：rJava load error in RStudio/R after "upgrading" to OSX Yosemite

基本上从不安装rJava开始，在终端开始：

形成符号链接（注意，-f 标志将覆盖现有链接，避免您在“方法 2”中遇到的错误。

$ sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib

然后在 RStudio 中：

确保options('java.home') 不是NULL，并在必要时设置：

options("java.home"="/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre")

确保设置了JAVA_HOME 和LD_LIBRARY_PATH 环境变量，如果没有设置：

Sys.setenv(JAVA_HOME='/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home') Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH='$JAVA_HOME/jre/lib/server')

在此之后，我能够在 RStudio 中安装和加载 rJava 包

install.packages('rJava')
library(rJava)

【讨论】：

您的解决方案不起作用：错误：“rJava”的包或命名空间加载失败：“rJava”的 loadNamespace() 中的 .onLoad 失败，详细信息：(...)
在步骤 (1) 之后，您可以在 /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib 目录中设置一个附加符号链接到 /usr/local/lib/libjvm.dylib 文件，而不是设置环境变量来调整路径：ln -s /usr/local/lib/libjvm.dylib /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/

【解决方案2】：

这是我的解决方案

定义 R 库的路径，这里是 R 3.4 版本并打开目录：

cd /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib

删除 libjvm.dylib：

rm libjvm.dylib

从 Java 库创建指向 libjvm.dylib 的链接，这里是 jdk1.8.0_151 版本：

ln -s /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_151.jdk/Contents/Home/jre/lib/server/libjvm.dylib libjvm.dylib

现在转到 R 或 RStudio 并尝试：

library("rJava")

【讨论】：

这个方法对我有用。但是我从框架的 /lib 目录符号链接到已经符号链接的 /usr/local/lib/libjvm 与 ln -s /usr/local/lib/libjvm.dylib ./，而不是直接进入 java 8 目录。

【解决方案3】：

我为 java 9 做了同样的事情，它运行良好（macOS High Sierra），谢谢：

cd /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib
rm libjvm.dylib
ln -s /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib libjvm.dylib

【讨论】：

【解决方案4】：

我已经尝试了这个网站上的大部分建议，但没有一个奏效。对我来说唯一可行的解决方案是在这个Github site 网站上。

希望这能解决您的问题。

【讨论】：

【解决方案5】：

问题是 rJava 无法安装在 RStudio (Version 1.0.136) 中。以下对我有用（macOS Sierra version 10.12.6）（找到here）：

步骤一：从here下载并安装javaforosx.dmg

第 2 步：接下来，从 RStudio 内部运行命令：

install.packages("rJava", type = 'source')

【讨论】：