clusplot.default 中的错误：找不到对象“面板”[重复]

Question

最近我将我的 linux 服务器部署的闪亮应用程序的 R 从 3.3.3 升级到 3.4.1，现在我得到了这个错误，而不是集群图。

没有改变其他任何东西，也无法访问服务器来尝试调试它。我现在只有一条错误消息：

Warning: Error in clusplot.default: object 'spannel' not found
Stack trace (innermost first):
    104: clusplot.default
    103: clusplot
    102: eval
    101: eval
    100: withProgress
     99: renderPlot
     89: <reactive:plotObj>
     78: plotObj
     77: origRenderFunc
     76: output$KM_plot
      1: runApp

据我了解，spannel 是一个 C 函数，不幸的是我对 C 一无所知。

这是它在server.R 文件中的简要外观：clusplot(KMData, KM$cluster)

有什么想法吗？

Answer 1

R 升级弄乱了绑定到 shiny 的库，比较 .libPaths() 的输出，以便它们位于正确的目录中。还要确保永远不要以 sudo 运行 R，因为以 root 运行它可能会导致整个盒子崩溃