忽略 readr::read_csv 中的尾随分隔符答案

【问题标题】：Ignore trailing delimiters in readr::read_csv忽略 readr::read_csv 中的尾随分隔符
【发布时间】：2017-05-07 21:51:22
【问题描述】：

当我使用 readr::read_csv 读取包含尾随分隔符的 CSV 文件时，我收到一条警告，指出填写了缺少的列名。这是一个简短示例 CSV 文件的内容，用于重现此警告（存储以下 sn -p 在一个名为example.csv的文件中）：

A,B,C,
2,1,1,
14,22,5,
9,-4,8,
17,9,-3,

注意每行末尾的逗号。现在如果我用

加载这个文件

read_csv("example.csv")

我收到以下警告：

Missing column names filled in: 'X4'

即使我只想显式加载 3 列

read_csv("example.csv", col_types=cols_only(A=col_integer(),
                                            B=col_integer(),
                                            C=col_integer()))

我仍然收到警告消息。

这是预期的行为还是有什么方法可以告诉read_csv 它应该忽略除我指定的列之外的所有列？还是有另一种方法来整理这个（显然格式错误的）CSV，以便删除/忽略尾随分隔符？

【问题讨论】：

你能添加一个显示问题的小例子吗？警告会以某种方式影响输出还是只是一条消息？
这只是一条警告消息，但即使使用cols_only 所有列似乎都已导入，这似乎很奇怪。我编辑了我的问题以包含一个小的示例 CSV 文件来显示问题。

标签： r csv readr tidyverse

【解决方案1】：

我不认为你可以。从我在文档中可以看到，cols_only() 用于您已经加载的 R 对象。

但是，data.table 库中的 fread() 函数允许您在读入文件时选择特定的列名：

DT <- fread("filename.csv", select = c("colA","colB"))

【讨论】：

【解决方案2】：

这是另一个带有错误消息的示例。

> read_csv("1,2,3\n4,5,6", col_names = c("x", "y"))
Warning: 2 parsing failures.
row # A tibble: 2 x 5 col     row   col  expected    actual         file expected   <int> <chr>     <chr>     <chr>        <chr> actual 1     1  <NA> 2 columns 3 columns literal data file 2     2  <NA> 2 columns 3 columns literal data

# A tibble: 2 x 2
      x     y
  <int> <int>
1     1     2
2     4     5

这里是修复/破解。另请参阅此 SOF 链接。 Suppress reader parse problems in r

> suppressWarnings(read_csv("1,2,3\n4,5,6", col_names = c("x", "y")))
# A tibble: 2 x 2
      x     y
  <int> <int>
1     1     2
2     4     5

【讨论】：

这个blog post 描述了如何只捕获特定的警告。仅禁止显示此特定警告可能很有用。