【问题标题】:primer3 web error , Unrecognized tag, primer3_core Unrecognized tagPrimer3 web 错误,无法识别的标签,primer3_core 无法识别的标签
【发布时间】:2015-12-26 13:26:42
【问题描述】:

我尝试在 localhost 上运行primer3 web,但是选择primer时输出出现错误。

Primer3 输出:

无法识别的标签:PRIMER_THERMODYNAMIC_ALIGNMENT=1 ./primer3_core: 无法识别的标签:PRIMER_THERMODYNAMIC_ALIGNMENT=1

输入问题:无法识别的标签:PRIMER_THERMODYNAMIC_ALIGNMENT=1

(primer3_results.cgi 3.0.0 版)

【问题讨论】:

    标签: apache cgi bioinformatics primer3


    【解决方案1】:

    他们似乎删除了参数 PRIMER_THERMODYNAMIC_ALIGNMENT。现在您应该使用 PRIMER_THERMODYNAMIC_OLIGO_ALIGNMENTPRIMER_THERMODYNAMIC_TEMPLATE_ALIGNMENT。看看下面的链接:

    http://primer3.sourceforge.net/primer3_manual.htm

    “5. 版本 2.2.3 的变化”部分。我想你使用的新版本大于 2.2.3,它有新的参数。

    【讨论】:

    • 是的,我使用的是最新版本 2.3.6,并且我使用的是 web prime3 v.3.0.0。如何修复
    • @irwanDwiyanto 这是系统中的一个错误,请开发人员修复它或使用版本 4.0.0(似乎可以工作http://bioinfo.ut.ee/primer3/
    • 很好,我使用在 localhost 上运行的primer3 web 版本 4.0.0,谢谢
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