【发布时间】：2015-03-15 10:16:51
【问题描述】：
我正在使用 glmnet 运行 coxph 模型。以下是我正在使用的代码：
data <- read.csv("CSM Tiers by Org.csv", stringsAsFactors = FALSE, na.strings = "?")
x <- model.matrix(~ data$CSM + data$Exclude + data$Queue)
y <- data$Time
status <- data$Event
glmnet(x,Surv(y,status), family = "cox")
但是，我收到以下错误：
Error in coxnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs, :
negative event times encountered; not permitted for Cox family
但我的数据中没有看到任何负面事件时间。
> sum(y<0)
[1] 0
非常感谢任何帮助！
【问题讨论】：
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没有数据会犯这个错误reproducible，很难帮你。
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@MrFlick：我正在尝试上传数据……但是文件太大了。
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我们不需要您的确切输入文件。请参阅我为创建代表性输入数据集提供的链接中的提示。它必须足以触发您遇到的完全相同的错误。
标签： r glmnet cox-regression