CRON 不执行 R 脚本文件

Question

我正在尝试自动运行存储在桌面文件夹 (cron_test) 中的 R 中的脚本 (test.R)。我在我的 mac 终端中使用 CRON。示例 R 脚本生成随机数、绘制它们并将它们保存到 PDF：

setwd("~/Desktop/cron_test")

pdf("example_plot.pdf", width = 8, height = 8)
plot(rnorm(100))
dev.off()

我的 CRON 代码尝试每分钟调用一次，但文件夹中没有任何内容：

* * * * * Rscript /Users/username/Desktop/cron_test/test.R

没有生成任何东西。我尝试了以下方法：

• 如果我从终端调用该文件运行良好，则表明代码没有问题：

  Rscript /Users/username/Desktop/cron_test/test.R

• 根据this proposed answer to a similar issue，我还确保（并仔细检查）文件的权限具有可执行权限：

  chmod 777 /Users/username/Desktop/cron_test/test.R

• 我还尝试了此答案中提出的另一个解决方案，即创建一个调用 R 脚本的 shell 文件。这也不行。

我收到邮件表明 CRON 任务已运行，但我的 cron_test 文件夹中没有出现任何输出。

Answer 1

邮件说

/bin/sh: Rscript: command not found

?

如果是这样，请尝试使用Rscript 的完整路径。您可以使用

从终端中找到它

$ which Rscript

这是因为与交互式终端相比，您在 cron 会话中获得的环境要小得多。您可以通过比较

的输出来检查这一点

$ /usr/bin/env > env-interactive

还有 cron 作业

* * * * * /usr/bin/env > env-cron

通过计算每个文件中的行数，我们可以看到它们完全不同。

$ wc -l env-{interactive,cron}
      20 env-interactive
       8 env-cron

特别是 cron 作业中的 shell 可执行文件搜索路径 ($PATH) 要短得多

$ grep PATH env-{interactive,cron}
env-interactive:PATH=/Users/hpcchris/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/munki:/opt/X11/bin:/Applications/Wireshark.app/Contents/MacOS:/Users/hpcchris/bin
env-cron:PATH=/usr/bin:/bin

（使用完整路径 /usr/local/bin/Rscript 在我的 macos High Sierra 笔记本电脑上使用 R 为我工作并制作了情节。）