【问题标题】:How to group dataframe rows into list in pandas groupby如何将数据帧行分组到 pandas groupby 中的列表中
【发布时间】:2023-01-30 16:21:40
【问题描述】:

我有一个 pandas 数据框df,比如:

a b
A 1
A 2
B 5
B 5
B 4
C 6

我想要按第一列分组并将第二列作为行列表:

A [1,2]
B [5,5,4]
C [6]

是否可以使用 pandas groupby 做这样的事情?

【问题讨论】:

  • 想象一个场景,如果 A 的元素列表的总和超过 10,我想添加另一个 A 记录。如何实现?

标签: python pandas list aggregate pandas-groupby


【解决方案1】:

您可以使用 groupby 对感兴趣的列进行分组,然后使用 apply list 对每个组进行分组:

In [1]: df = pd.DataFrame( {'a':['A','A','B','B','B','C'], 'b':[1,2,5,5,4,6]})
        df

Out[1]: 
   a  b
0  A  1
1  A  2
2  B  5
3  B  5
4  B  4
5  C  6

In [2]: df.groupby('a')['b'].apply(list)
Out[2]: 
a
A       [1, 2]
B    [5, 5, 4]
C          [6]
Name: b, dtype: object

In [3]: df1 = df.groupby('a')['b'].apply(list).reset_index(name='new')
        df1
Out[3]: 
   a        new
0  A     [1, 2]
1  B  [5, 5, 4]
2  C        [6]

【讨论】:

  • 如果数据集很大,比如 1000 万行,这会花费很多时间。有没有更快的方法来做到这一点?然而,“a”中的唯一身份数量约为 500k
  • groupby 是出了名的慢而且内存不足,你可以做的是按 A 列排序,然后找到 idxmin 和 idxmax(可能将其存储在字典中)并使用它来切片你的数据帧我认为会更快
  • 当我针对我的问题尝试此解决方案时(有多个列用于 groupBy 和分组),它不起作用 - 熊猫发送“功能不减少”。然后我在第二个答案之后使用了tuplestackoverflow.com/questions/19530568/…。请参阅stackoverflow.com/questions/27439023/… 中的第二个答案以获取解释。
  • @PoeteMaudit 抱歉,我不明白你在问什么,在 cmets 中提问在 SO 中是错误的形式。您是在问如何将多个列连接成一个列表吗?
  • 有没有办法一次做多列? df1 = df.groupby('a')['b','c'].apply(list).reset_index(name='new')
【解决方案2】:

一个方便的方法来实现这一点是:

df.groupby('a').agg({'b':lambda x: list(x)})

考虑编写自定义聚合:https://www.kaggle.com/akshaysehgal/how-to-group-by-aggregate-using-py

【讨论】:

  • lambda args: f(args)等同于f
  • 其实agg(list)就够了。另见here
  • !!我只是在谷歌上搜索一些语法,然后意识到解决方案引用了我自己的笔记本,哈哈。感谢您链接此。只是补充一点,因为'list'不是一个系列函数,你必须将它与apply df.groupby('a').apply(list)一起使用,或者将它与agg一起用作dict df.groupby('a').agg({'b':list})的一部分。您也可以将它与 lambda(我推荐)一起使用,因为您可以用它做更多的事情。示例:df.groupby('a').agg({'c':'first', 'b': lambda x: x.unique().tolist()}),它允许您将一个系列函数应用于 col c,并将一个唯一的列表函数应用于 col b。
【解决方案3】:

如果性能很重要,请降低到 numpy 级别:

import numpy as np

df = pd.DataFrame({'a': np.random.randint(0, 60, 600), 'b': [1, 2, 5, 5, 4, 6]*100})

def f(df):
         keys, values = df.sort_values('a').values.T
         ukeys, index = np.unique(keys, True)
         arrays = np.split(values, index[1:])
         df2 = pd.DataFrame({'a':ukeys, 'b':[list(a) for a in arrays]})
         return df2

测试:

In [301]: %timeit f(df)
1000 loops, best of 3: 1.64 ms per loop

In [302]: %timeit df.groupby('a')['b'].apply(list)
100 loops, best of 3: 5.26 ms per loop

【讨论】:

  • 如果我们按两个或多个键分组,我们如何使用它,例如用.groupby([df.index.month, df.index.day])而不是.groupby('a')
  • @ru111 我在下面添加了一个 answer,您可能想查看它。它还处理多列分组
【解决方案4】:

要为数据框的多列解决此问题:

In [5]: df = pd.DataFrame( {'a':['A','A','B','B','B','C'], 'b':[1,2,5,5,4,6],'c'
   ...: :[3,3,3,4,4,4]})

In [6]: df
Out[6]: 
   a  b  c
0  A  1  3
1  A  2  3
2  B  5  3
3  B  5  4
4  B  4  4
5  C  6  4

In [7]: df.groupby('a').agg(lambda x: list(x))
Out[7]: 
           b          c
a                      
A     [1, 2]     [3, 3]
B  [5, 5, 4]  [3, 4, 4]
C        [6]        [4]

这个答案的灵感来自于Anamika Modi的回答。谢谢!

【讨论】:

    【解决方案5】:

    使用以下任何groupbyagg 食谱。

    # Setup
    df = pd.DataFrame({
      'a': ['A', 'A', 'B', 'B', 'B', 'C'],
      'b': [1, 2, 5, 5, 4, 6],
      'c': ['x', 'y', 'z', 'x', 'y', 'z']
    })
    df
    
       a  b  c
    0  A  1  x
    1  A  2  y
    2  B  5  z
    3  B  5  x
    4  B  4  y
    5  C  6  z
    

    要将多个列聚合为列表,请使用以下任一方法:

    df.groupby('a').agg(list)
    df.groupby('a').agg(pd.Series.tolist)
    
               b          c
    a                      
    A     [1, 2]     [x, y]
    B  [5, 5, 4]  [z, x, y]
    C        [6]        [z]
    

    要仅对单个列进行分组列表,请将 groupby 转换为 SeriesGroupBy 对象,然后调用 SeriesGroupBy.agg。利用,

    df.groupby('a').agg({'b': list})  # 4.42 ms 
    df.groupby('a')['b'].agg(list)    # 2.76 ms - faster
    
    a
    A       [1, 2]
    B    [5, 5, 4]
    C          [6]
    Name: b, dtype: object
    

    【讨论】:

    • 是上面的方法保证维持秩序?意味着来自同一行的元素(但不同的列,bC在上面的代码中)将在结果列表中具有相同的索引?
    • @Kai哦,好问题。是和不是。 GroupBy 按石斑鱼键值对输出进行排序。然而,排序通常是稳定的,因此每组的相对顺序得以保留。要完全禁用排序行为,请使用groupby(..., sort=False)。在这里,这没有什么区别,因为我在已经排序的 A 列上进行分组。
    • 这是一个非常好的答案!还有一种方法可以使列表的值唯一吗?可能是 .agg(pd.Series.tolist.unique) 之类的东西?
    • @FedericoGentile 你可以使用 lambda。这是一种方式:df.groupby('a')['b'].agg(lambda x: list(set(x)))
    • @Moondra 不确定,也许你想要df.groupby('a').agg(lambda x: x.to_numpy().ravel().tolist())
    【解决方案6】:

    正如您所说,pd.DataFrame 对象的 groupby 方法可以完成这项工作。

    例子

     L = ['A','A','B','B','B','C']
     N = [1,2,5,5,4,6]
    
     import pandas as pd
     df = pd.DataFrame(zip(L,N),columns = list('LN'))
    
    
     groups = df.groupby(df.L)
    
     groups.groups
          {'A': [0, 1], 'B': [2, 3, 4], 'C': [5]}
    

    它给出了组的索引描述。

    要获取单个组的元素,您可以这样做,例如

     groups.get_group('A')
    
         L  N
      0  A  1
      1  A  2
    
      groups.get_group('B')
    
         L  N
      2  B  5
      3  B  5
      4  B  4
    

    【讨论】:

      【解决方案7】:

      是时候使用 agg 而不是 apply 了。

      什么时候

      df = pd.DataFrame( {'a':['A','A','B','B','B','C'], 'b':[1,2,5,5,4,6], 'c': [1,2,5,5,4,6]})
      

      如果要将多列堆叠到 list 中,则结果为 pd.DataFrame

      df.groupby('a')[['b', 'c']].agg(list)
      # or 
      df.groupby('a').agg(list)
      

      如果你想要列表中的单列,结果为ps.Series

      df.groupby('a')['b'].agg(list)
      #or
      df.groupby('a')['b'].apply(list)
      

      请注意,当您仅聚合单列时,pd.DataFrame 的结果比ps.Series 的结果慢约 10 倍,在多列情况下使用它。

      【讨论】:

        【解决方案8】:

        只是一个补充。 pandas.pivot_table更通用也更方便:

        """data"""
        df = pd.DataFrame( {'a':['A','A','B','B','B','C'],
                            'b':[1,2,5,5,4,6],
                            'c':[1,2,1,1,1,6]})
        print(df)
        
           a  b  c
        0  A  1  1
        1  A  2  2
        2  B  5  1
        3  B  5  1
        4  B  4  1
        5  C  6  6
        
        """pivot_table"""
        pt = pd.pivot_table(df,
                            values=['b', 'c'],
                            index='a',
                            aggfunc={'b': list,
                                     'c': set})
        print(pt)
                   b       c
        a                   
        A     [1, 2]  {1, 2}
        B  [5, 5, 4]     {1}
        C        [6]     {6}
        

        【讨论】:

          【解决方案9】:

          如果寻找一个独特 列表在对多列进行分组时,这可能会有所帮助:

          df.groupby('a').agg(lambda x: list(set(x))).reset_index()
          

          【讨论】:

            【解决方案10】:

            @B.M answer 的基础上,这是一个更通用的版本,并已更新以配合使用较新的库版本: (numpy 版本1.19.2,熊猫版本1.2.1) 而且这个解决方案还可以处理多指标:

            但是,这没有经过严格测试,请谨慎使用。

            如果性能很重要,请降低到 numpy 级别:

            import pandas as pd
            import numpy as np
            
            np.random.seed(0)
            df = pd.DataFrame({'a': np.random.randint(0, 10, 90), 'b': [1,2,3]*30, 'c':list('abcefghij')*10, 'd': list('hij')*30})
            
            
            def f_multi(df,col_names):
                if not isinstance(col_names,list):
                    col_names = [col_names]
                    
                values = df.sort_values(col_names).values.T
            
                col_idcs = [df.columns.get_loc(cn) for cn in col_names]
                other_col_names = [name for idx, name in enumerate(df.columns) if idx not in col_idcs]
                other_col_idcs = [df.columns.get_loc(cn) for cn in other_col_names]
            
                # split df into indexing colums(=keys) and data colums(=vals)
                keys = values[col_idcs,:]
                vals = values[other_col_idcs,:]
                
                # list of tuple of key pairs
                multikeys = list(zip(*keys))
                
                # remember unique key pairs and ther indices
                ukeys, index = np.unique(multikeys, return_index=True, axis=0)
                
                # split data columns according to those indices
                arrays = np.split(vals, index[1:], axis=1)
            
                # resulting list of subarrays has same number of subarrays as unique key pairs
                # each subarray has the following shape:
                #    rows = number of non-grouped data columns
                #    cols = number of data points grouped into that unique key pair
                
                # prepare multi index
                idx = pd.MultiIndex.from_arrays(ukeys.T, names=col_names) 
            
                list_agg_vals = dict()
                for tup in zip(*arrays, other_col_names):
                    col_vals = tup[:-1] # first entries are the subarrays from above 
                    col_name = tup[-1]  # last entry is data-column name
                    
                    list_agg_vals[col_name] = col_vals
            
                df2 = pd.DataFrame(data=list_agg_vals, index=idx)
                return df2
            

            测试:

            In [227]: %timeit f_multi(df, ['a','d'])
            
            2.54 ms ± 64.7 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
            
            In [228]: %timeit df.groupby(['a','d']).agg(list)
            
            4.56 ms ± 61.5 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
            
            
            

            结果:

            对于随机种子 0,一个人会得到:

            【讨论】:

            • 很好的答案。请分享示例,如果您只需要一列而不是多列
            【解决方案11】:

            我发现实现相同目的的最简单方法,至少对于一列,类似于Anamika's answer,只是使用聚合函数的元组语法。

            df.groupby('a').agg(b=('b','unique'), c=('c','unique'))
            

            【讨论】:

              【解决方案12】:

              让我们将 df.groupby 与列表和 Series 构造函数一起使用

              pd.Series({x : y.b.tolist() for x , y in df.groupby('a')})
              Out[664]: 
              A       [1, 2]
              B    [5, 5, 4]
              C          [6]
              dtype: object
              

              【讨论】:

                【解决方案13】:

                在这里,我用“|”对元素进行了分组作为分隔符

                    import pandas as pd
                
                    df = pd.read_csv('input.csv')
                
                    df
                    Out[1]:
                      Area  Keywords
                    0  A  1
                    1  A  2
                    2  B  5
                    3  B  5
                    4  B  4
                    5  C  6
                
                    df.dropna(inplace =  True)
                    df['Area']=df['Area'].apply(lambda x:x.lower().strip())
                    print df.columns
                    df_op = df.groupby('Area').agg({"Keywords":lambda x : "|".join(x)})
                
                    df_op.to_csv('output.csv')
                    Out[2]:
                    df_op
                    Area  Keywords
                
                    A       [1| 2]
                    B    [5| 5| 4]
                    C          [6]
                

                【讨论】:

                  【解决方案14】:

                  答案基于@EdChum 对他的回答的评论。评论是这样的——

                  groupby is notoriously slow and memory hungry, what you could do is sort by column A, then find the idxmin and idxmax (probably store this in a dict) and use this to slice your dataframe would be faster I think 
                  

                  让我们首先创建一个数据框,第一列有 500k 个类别,总 df 形状为 2000 万,如问题所述。

                  df = pd.DataFrame(columns=['a', 'b'])
                  df['a'] = (np.random.randint(low=0, high=500000, size=(20000000,))).astype(str)
                  df['b'] = list(range(20000000))
                  print(df.shape)
                  df.head()
                  
                  # Sort data by first column 
                  df.sort_values(by=['a'], ascending=True, inplace=True)
                  df.reset_index(drop=True, inplace=True)
                  
                  # Create a temp column
                  df['temp_idx'] = list(range(df.shape[0]))
                  
                  # Take all values of b in a separate list
                  all_values_b = list(df.b.values)
                  print(len(all_values_b))
                  
                  # For each category in column a, find min and max indexes
                  gp_df = df.groupby(['a']).agg({'temp_idx': [np.min, np.max]})
                  gp_df.reset_index(inplace=True)
                  gp_df.columns = ['a', 'temp_idx_min', 'temp_idx_max']
                  
                  # Now create final list_b column, using min and max indexes for each category of a and filtering list of b. 
                  gp_df['list_b'] = gp_df[['temp_idx_min', 'temp_idx_max']].apply(lambda x: all_values_b[x[0]:x[1]+1], axis=1)
                  
                  print(gp_df.shape)
                  gp_df.head()
                  

                  对于第一列中的 2000 万行和 50 万个类别,上面的代码需要 2 分钟。

                  【讨论】:

                    【解决方案15】:

                    排序消耗O(nlog(n))时间,这是上面建议的解决方案中最耗时的操作

                    对于一个简单的解决方案(包含单列)pd.Series.to_list 可以工作并且可以被认为更有效,除非考虑其他框架

                    例如

                    import pandas as pd
                    from string import ascii_lowercase
                    import random
                    
                    def generate_string(case=4):
                        return ''.join([random.choice(ascii_lowercase) for _ in range(case)])
                    
                    df = pd.DataFrame({'num_val':[random.randint(0,100) for _ in range(20000000)],'string_val':[generate_string() for _ in range(20000000)]})
                    
                    
                    %timeit df.groupby('string_val').agg({'num_val':pd.Series.to_list})
                    

                    对于 2000 万条记录,大约需要 17.2 seconds。与apply(list)相比,它需要大约19.2,而lambda函数需要大约20.6s

                    【讨论】:

                      【解决方案16】:

                      只是为了增加以前的答案,就我而言,我想要列表和其他功能,如minmax。这样做的方法是:

                      df = pd.DataFrame({
                          'a':['A','A','B','B','B','C'], 
                          'b':[1,2,5,5,4,6]
                      })
                      
                      df=df.groupby('a').agg({
                          'b':['min', 'max',lambda x: list(x)]
                      })
                      
                      #then flattening and renaming if necessary
                      df.columns = df.columns.to_flat_index()
                      df.rename(columns={('b', 'min'): 'b_min', ('b', 'max'): 'b_max', ('b', '<lambda_0>'): 'b_list'},inplace=True)
                      

                      【讨论】:

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