使用 Python 删除 csv 文件中包含特定文本的行答案

【问题标题】：Removal of rows containing a particular text in a csv file using Python使用 Python 删除 csv 文件中包含特定文本的行
【发布时间】：2023-01-19 22:01:05
【问题描述】：

我有一个包含 3500 多行的基因组数据集。我需要从中删除两列（“长度”和“蛋白质名称”）中的行。我如何为此目的指定条件。

import csv #importing the csv module or method

#opening a new csv file 
file = open('C:\\Users\\Admin\\Downloads\\csv.csv', 'r')
type(file)

#reading the csv file 
csvreader = csv.reader(file)
header = []
header = next(csvreader)
print(header)

#extracting rows from the csv file
rows = []
for row in csvreader:
    rows.append(row)
print(rows)

我是python生物信息学数据分析的初学者，没有尝试过任何广泛的方法。我不知道如何从这里开始。我已经完成了打开和读取 csv 文件的工作。我还提取了列标题。但我不知道如何从这里开始。请帮忙。

【问题讨论】：

您需要从“长度”和“蛋白质名称”列中删除所有行吗？
或者您是否需要从每一行中删除“长度”和“蛋白质名称”列？

标签： python dataframe csv row readfile

【解决方案1】：

尝试这个：

csvreader= csvreader[csvreader["columnName"].str.contains("string to delete") == False]

【讨论】：

【解决方案2】：

最好在 pandas 中阅读 scv，因为你有很多行。这将是做出的明智决定。并设置一些您将用于执行操作的条件变量。如果这没有帮助。我建议您提供 scv 文件的示例数据。

df = pd.read_csv('C:\Users\Admin\Downloads\csv.csv')

length = 10
protein_name = "replace with protain name"

df = df[(df["Length"] > length) & (df["Protein Name"] != protein_name)]
print(df)

如果需要，您可以将 df 保存回 csv 文件：

df.to_csv("'C:\Users\Admin\Downloads\new_csv.csv'", index=False)

【讨论】：