如何将文本文件中的列名和行名插入矩阵？答案

【问题标题】：How to insert colnames and rownames from a textfile onto matrix?如何将文本文件中的列名和行名插入矩阵？
【发布时间】：2022-12-18 21:37:00
【问题描述】：

我有一个包含 5777 列和行的方阵。

head(data)
1.3 4.5 6 7 8.9 0 7.6
4.5 6.7 8 9 0.1 8 7.2
4.5 6 7 8.9 0.1 8 8.3
6.7 8 9 0.1 7.9 6.0 5
2.4 6.7 8 3 0.1 8 7.4 
8 9 0.1 7.9 6.0 5 5.6

我想将列名和行名插入到矩阵中。这些存在于文本文件中。此文本文件的总行数为 5777。

head(file.txt)

A1
B2
C3
D4
E5
F6
G7

我怎样才能在矩阵中插入列表（行名和列名），所以它看起来像这样

A1 B2 C3 D4 E5 F6 G7
B2 1.3 4.5 6 7 8.9 0 7.6
C3 4.5 6.7 8 9 0.1 8 7.2
D4 4.5 6 7 8.9 0.1 8 8.3
E5 6.7 8 9 0.1 7.9 6.0 5
F6 2.4 6.7 8 3 0.1 8 7.4 
G7 8 9 0.1 7.9 6.0 5 5.6

我努力了

#read in row names and column names  
names <- read.table("armlympho_matrix.snplist")

#read in matrix
data <- read.table("armlympho_matrix.ld")

#set the row names and column names in matrix 
colnames(data) <- names 
rownames(data) <- names 
 

ERROR: 

Error in `.rowNamesDF<-`(x, value = value) : invalid 'row.names' length
Calls: rownames<- ... row.names<- -> row.names<-.data.frame -> .rowNamesDF<-
Execution halted

输出完全错误

c("A1" "B2" "C3" "D4" "E5" "F6" "G7")
NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA NA NA NA

【问题讨论】：

read.table 返回一个数据框。如果必须使用第一列作为列名，请使用colnames(data) <- header[[1]]。否则请准确描述您正在运行的代码的问题所在。
请试试header <- scan("file.txt", what = character())。

标签： r

【解决方案1】：

要将 file.txt 文件中的行名和列名插入矩阵，可以使用 row.names 和 colnames 函数。这是您如何执行此操作的示例：

# Read in your matrix
data <- read.table(...)

# Read in the row names and column names from file.txt
names <- read.table(file.txt)

# Set the row names and column names of your matrix
row.names(data) <- names
colnames(data) <- names

此代码将从 file.txt 中读取您的矩阵和行名和列名，然后它将使用 row.names 和 colnames 函数将矩阵的行名和列名设置为名称中的值。

【讨论】：

看我的编辑。我收到一个错误。