如何打印包含部分输入的所有行？答案

【问题标题】：How to print all rows containing a part of input?如何打印包含部分输入的所有行？
【发布时间】：2022-11-29 05:11:28
【问题描述】：

我有一个包含序列和基因名称的 csv 文件。我想从用户那里获取输入并打印包含用户输入的所有行作为一部分。例如我的数据是；

Gene 1    ATGCGGTCTA
Gene 2    ACGCCCATGA
Gene 3    TCGAC

当用户进入 GC 时，结果必须是

Gene 1   ATGCGGTCTA 
Gene 2   ACGCCCATGA

因为两者在序列中都有 GC。

到目前为止，我尝试；

import csv
import sys
import pandas as pd
csv_file = csv.reader(open('DATA.csv', "r"), delimiter=",")
z=input('what would you like to search?').lower()
if z=='sequence':
 s=input('Enter sequence : ').upper()
 df = pd.read_csv('DATA.csv')
 a = list(df['seq'])
 b = ' '.join(str(s) for s in a)
 c= b.find(s)

【问题讨论】：

您混合使用 2 种不同的方法来处理 CSV，即纯 Python 方法和 pandas 方法。您可以删除 pandas 并迭代 csv_file 的行。

标签： python python-3.x list input sequence

【解决方案1】：

使用pandas 并假设您的数据框的序列列称为sequences，您可以执行以下操作： filtered_df = df[df['sequences'].str.contains(s)]

【讨论】：