使用 unix 将文本文件中的所有空格替换为下划线

Question

对不起，如果这是一个重复的问题；我对 unix 很陌生。

我有几个 (n = 12) 文本文件，它们在第一列中包含空格，应该全部更改为下划线。这些文件具有系统发育 ID 和不同样本中的计数，请参见下面的示例。

phylodist   all_Tg_3300056613   all_Tg_3300056890   all_Tg_3300057214   all_Tg_3300057270   all_Tg_3300057271
Archaea;Candidatus Diapherotrites;unclassified Candidatus Diapherotrites;unclassified Candidatus Diapherotrites;unclassified Candidatus Diapherotrites;Candidatus Iainarchaeum;Candidatus Iainarchaeum andersonii;Candidatus Iainarchaeum andersonii SCGC AAA011-E11 (contamination screened)   5.91123918323401        12.3266217289478        2.01841255189448        0   0
Archaea;Candidatus Korarchaeota;unclassified Candidatus Korarchaeota;unclassified Candidatus Korarchaeota;unclassified Candidatus Korarchaeota;Candidatus Korarchaeum;Candidatus Korarchaeum cryptofilum;Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8        419.386679750923        502.442103336035        446.524450581103    0   0
Archaea;Candidatus Micrarchaeota;unclassified Candidatus Micrarchaeota;unclassified Candidatus Micrarchaeota;unclassified Candidatus Micrarchaeota;Candidatus Mancarchaeum;Candidatus Mancarchaeum acidiphilum;Candidatus Mancarchaeum acidiphilum Mia14        7.5272438877384 4.95622132293645        0   0   0
Archaea;Candidatus Thermoplasmatota;Candidatus Poseidoniia;Candidatus Poseidoniales;unclassified Candidatus Poseidoniales;unclassified Candidatus Poseidoniales;uncultured Candidatus Poseidoniales archaeon;Candidatus Poseidoniales archaeon AHCG     5.15021284928401        6.49674226828345        0   0   0

我的目标是将文件作为 DESeq2 对象上传到 R，以“;”分隔。处理我所有文件的简单方法是什么？

Answer 1

使用 sed 命令：

sed -i 's/ /_/' *.txt

由于替换命令中没有 g 修饰符，这将仅用下划线替换每行中的第一个空格。