如何在matlab的pdist中添加点积作为距离函数

Question

mat_vec=zeros(100,10000);

点积是dot(xi, xj)

distanceFunction = @(xi, xj)dot(xi, xj)
mat_dist=pdist(mat_vec, distanceFunction)

错误信息如

distanceFunction =

  function_handle with value:

    @(xi,xj)dot(xi,xj)

Error using pdist
Error evaluating distance function '@(xi,xj)dot(xi,xj)'.

Error in Task1_lab404_02 (line 45)
mat_dist=pdist(mat_vec, distanceFunction)

Caused by:
    Error using dot
    A and B must be same size.

Answer 1

来自pdist documentation（强调我的）：

距离函数的形式为

function D2 = distfun(ZI,ZJ)

在哪里

ZI 是一个包含单个观察值的 1-by-n 向量。

ZJ 是一个包含多个观察值的 m2-by-n 矩阵。该函数必须接受一个矩阵ZJ，其中包含任意数量的观察值.

所以你需要定义函数矢量化在第二个输入。对于非常简单的点积，使用matrix multiplication：

distanceFunction = @(xi, xj) xi*xj';

或implicit expansion：

distanceFunction = @(xi, xj) sum(xi.*conj(xj), 2);

但是请注意，这是不是真正的距离函数，因为对于复杂的输入，distanceFunction(a, b) 与 distanceFunction(b, a) 不同。应用 pdist 只会为每一对给出其中一个结果。