numpy 初学者：使用 numpy.savetxt 编写数组答案

【问题标题】：numpy beginner: writing an array using numpy.savetxtnumpy 初学者：使用 numpy.savetxt 编写数组
【发布时间】：2012-06-10 19:53:50
【问题描述】：

我有一个 numpy 直方图，我想将其输出为制表符分隔的文本文件。我的代码如下：

targethist = np.histogram(targetlist, bins=ilist)
print targethist
np.savetxt('ChrI_dens.txt',targethist,delimiter='\t')

targetlist 和 ilist 是很长的整数列表。我得到以下输出：

(array([0, 0, 0, ..., 0, 0, 0]), array([ 1, 10000, 20000, ..., 15060000, 15070000, 15072422])) 回溯（最近的通话最后）：文件“target_dens_np.py”，第 62 行，在 np.savetxt('ChrI_dens.txt',targethist,delimiter='\t') 文件 "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/7.3/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/npyio. py", 第 979 行，在 savetxt 中 fh.write(asbytes(format % tuple(row) + newline)) TypeError: float argument required, not numpy.ndarray

好像已经创建了直方图数组，但是我在 np.savetxt() 行中做错了。我已阅读文档，但不明白为什么此函数中的任何参数都需要浮点数。我哪里出错了？

【问题讨论】：

标签： python numpy histogram tsv

【解决方案1】：

我认为问题在于savetxt 的第二个参数必须是“类数组”。您的输入不是“类似数组的”。例如

print (len(targethist[0]))
print (len(targethist[1]))

注意长度不一样？如果长度相同，numpy 可以将其转换为单个二维数组，一切都会好起来的，但它不能进行转换，所以它失败了。

这行得通

np.savetxt('stuff.dat',(targethist[0],targethist[1][1:]),delimiter='\t')

但是我已经截断了你的数据；）。你需要决定你想做什么来解决这个问题。

我必须承认，这里的错误信息非常神秘。

【讨论】：

看准了！无论如何，这应该在我遇到神秘错误之前发生。事实证明，我想截断较长数组中的第一个整数，所以这是完美的。谢谢！
@pandaSeq 我不得不承认——基于那个回溯，我在这个问题上摸索了几分钟。通常当 python-numpy 问题在 SO 上停留超过 10 分钟而没有任何答案时，你就会知道发生了一些有趣的事情;)。