【问题标题】:Apache Spark fails to process a large Cassandra column familyApache Spark 无法处理大型 Cassandra 列族
【发布时间】:2015-09-09 07:18:30
【问题描述】:

我正在尝试使用 Apache Spark 来处理我的大型(约 230k 条目)cassandra 数据集,但我经常遇到不同类型的错误。但是,在数据集 ~200 个条目上运行时,我可以成功运行应用程序。我有 3 个节点的 spark 设置,1 个 master 和 2 个 worker,2 个 worker 还安装了 cassandra 集群,数据索引的复制因子为 2。我的 2 个 spark worker 在 Web 界面上显示 2.4 和 2.8 GB 内存,我在运行应用程序时将spark.executor.memory 设置为 2409,以获得 4.7 GB 的组合内存。这是我的 WebUI 主页

其中一项任务的环境页面

在这个阶段,我只是尝试使用 spark 处理存储在 cassandra 中的数据。这是我在 Java 中用来执行此操作的基本代码

SparkConf conf = new SparkConf(true)
        .set("spark.cassandra.connection.host", CASSANDRA_HOST)
        .setJars(jars);

SparkContext sc = new SparkContext(HOST, APP_NAME, conf);
SparkContextJavaFunctions context = javaFunctions(sc);

CassandraJavaRDD<CassandraRow> rdd = context.cassandraTable(CASSANDRA_KEYSPACE, CASSANDRA_COLUMN_FAMILY);

System.out.println(rdd.count());

为了成功运行,在一个小数据集(200 个条目)上,事件界面看起来像这样

但是当我在大型数据集上运行相同的东西时(即我只更改CASSANDRA_COLUMN_FAMILY),作业永远不会在终端内终止,日志看起来像这样

大约 2 分钟后,执行者的标准错误看起来像这样

大约 7 分钟后,我得到了

Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded

在我的终端中,我必须手动终止 SparkSubmit 进程。但是,大型数据集是从仅占用 22 MB 的二进制文件中索引的,并且在执行nodetool status 时,我可以看到我的两个 cassandra 节点中仅存储了约 115 MB 的数据。我也尝试在我的数据集上使用 Spark SQL,但也得到了类似的结果。对于 Transformation-Action 程序和使用 Spark SQL 的程序,我的设置哪里出了问题,我应该怎么做才能成功处理我的数据集。

我已经尝试过以下方法

  • 使用-Xms1G -Xmx1G 增加内存,但程序失败并出现异常说我应该设置spark.executor.memory,我有。

  • 使用spark.cassandra.input.split.size,它说它不是一个有效的选项失败,类似的选项是spark.cassandra.input.split.size_in_mb,我设置为1,没有效果。

编辑

基于this的回答,我也尝试了以下方法:

  • spark.storage.memoryFraction设置为0

  • 未将spark.storage.memoryFraction 设置为零并将persistMEMORY_ONLYMEMORY_ONLY_SERMEMORY_AND_DISKMEMORY_AND_DISK_SER 一起使用。

版本:

  • 火花:1.4.0

  • 卡桑德拉:2.1.6

  • spark-cassandra-connector:1.4.0-M1

【问题讨论】:

  • 尝试增加驱动内存。驱动程序默认为 512MB
  • 我尝试根据我的free -m 输出为spark.driver.memory 设置不同的值,但结果是一样的。

标签: java cassandra apache-spark apache-spark-sql spark-cassandra-connector


【解决方案1】:

我认为最新的 spark-cassandra-connector 存在问题。参数spark.cassandra.input.split.size_in_mb 应该具有默认值 64 MB,在代码中被解释为 64 字节。这会导致创建的分区太多,spark无法调度。尝试将 conf 值设置为

spark.cassandra.input.split.size_in_mb=67108864

【讨论】:

  • 确实,好像有bug。
  • 非常感谢。目前,它适用于 230782 条记录的输入,标准程序需要大约 5 分钟的 3 个分区,而等效的 spark SQL 程序创建 7 个分区并在 8 秒内完成!干杯!
  • 这真是太可悲了。我浪费了 2 天的时间来解决问题,然后就解决了。我遇到了同样的问题。谢谢
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