【问题标题】:Comparing two NumPy arrays for equality, element-wise按元素比较两个 NumPy 数组的相等性
【发布时间】:2012-05-21 18:44:15
【问题描述】:

比较两个 NumPy 数组是否相等(其中相等定义为:A = B iff 对于所有索引 i:A[i] == B[i])的最简单方法是什么?

只需使用== 就可以得到一个布尔数组:

 >>> numpy.array([1,1,1]) == numpy.array([1,1,1])

array([ True,  True,  True], dtype=bool)

我必须and这个数组的元素来确定数组是否相等,还是有更简单的比较方法?

【问题讨论】:

    标签: python arrays numpy elementwise-operations


    【解决方案1】:
    (A==B).all()
    

    测试数组 (A==B) 的所有值是否为真。

    注意:也许你也想测试A和B形状,比如A.shape == B.shape

    特殊情况和替代方案(来自 dbaupp 的回答和 yoavram 的评论)

    需要注意的是:

    • 此解决方案在特定情况下可能会出现奇怪的行为:如果AB 为空且另一个包含单个元素,则返回True。出于某种原因,比较 A==B 返回一个空数组,all 运算符返回True
    • 另一个风险是,如果 AB 的形状不同且不可广播,那么这种方法会引发错误。

    总之,如果您对 AB 形状有疑问,或者只是为了安全起见:请使用其中一种特殊功能:

    np.array_equal(A,B)  # test if same shape, same elements values
    np.array_equiv(A,B)  # test if broadcastable shape, same elements values
    np.allclose(A,B,...) # test if same shape, elements have close enough values
    

    【讨论】:

    • 你几乎总是想要np.array_equal IME。 (A==B).all() 如果 A 和 B 的长度不同会崩溃。从 numpy 1.10 开始,== raises a deprecation warning in this case.
    • 你的观点很好,但如果我对形状有疑问,我通常更喜欢在值之前直接测试它。那么错误显然是在具有完全不同含义而不是具有不同值的形状上。但这可能取决于每个用例
    • 另一个风险是数组是否包含 nan。在这种情况下,您将得到 False 因为 nan != nan
    • 很高兴指出这一点。但是,我认为这是合乎逻辑的,因为nan!=nan 暗示array(nan)!=array(nan)
    • 我不理解这种行为:import numpy as np H = 1/np.sqrt(2)*np.array([[1, 1], [1, -1]]) #hadamard matrix np.array_equal(H.dot(H.T.conj()), np.eye(len(H))) # checking if H is an unitary matrix or not H 是酉矩阵,所以 H x H.T.conj 是单位矩阵。但是np.array_equal 返回 False
    【解决方案2】:

    (A==B).all() 解决方案非常简洁,但是有一些内置函数可以完成这项任务。即array_equalallclosearray_equiv

    (尽管对timeit 进行的一些快速测试似乎表明(A==B).all() 方法是最快的,这有点奇怪,因为它必须分配一个全新的数组。)

    【讨论】:

    • 你是对的,但如果比较的数组之一为空,你会得到(A==B).all() 的错误答案。例如,尝试:(np.array([1])==np.array([])).all(),它给出True,而np.array_equal(np.array([1]), np.array([])) 给出False
    • 我也刚刚发现了这种性能差异。这很奇怪,因为如果你有 2 个完全不同的数组,(a==b).all() 仍然比 np.array_equal(a, b) 快(它可能只检查了一个元素并退出)。
    • np.array_equal 也适用于lists of arraysdicts of arrays。这可能是性能变慢的原因。
    • 非常感谢allclose 函数,这是我进行numerical 计算所需要的。它比较 tolerance 内向量的相等性。 :)
    • 请注意np.array_equiv([1,1,1], 1) is True。这是因为:形状一致意味着它们要么是相同的形状,要么可以广播一个输入数组以创建与另一个相同的形状。
    【解决方案3】:

    让我们使用以下代码来衡量性能。

    import numpy as np
    import time
    
    exec_time0 = []
    exec_time1 = []
    exec_time2 = []
    
    sizeOfArray = 5000
    numOfIterations = 200
    
    for i in xrange(numOfIterations):
    
        A = np.random.randint(0,255,(sizeOfArray,sizeOfArray))
        B = np.random.randint(0,255,(sizeOfArray,sizeOfArray))
    
        a = time.clock() 
        res = (A==B).all()
        b = time.clock()
        exec_time0.append( b - a )
    
        a = time.clock() 
        res = np.array_equal(A,B)
        b = time.clock()
        exec_time1.append( b - a )
    
        a = time.clock() 
        res = np.array_equiv(A,B)
        b = time.clock()
        exec_time2.append( b - a )
    
    print 'Method: (A==B).all(),       ', np.mean(exec_time0)
    print 'Method: np.array_equal(A,B),', np.mean(exec_time1)
    print 'Method: np.array_equiv(A,B),', np.mean(exec_time2)
    

    输出

    Method: (A==B).all(),        0.03031857
    Method: np.array_equal(A,B), 0.030025185
    Method: np.array_equiv(A,B), 0.030141515
    

    根据上面的结果,numpy 方法似乎比 == 运算符和 all() 方法的组合更快,并且通过比较 numpy 方法最快的似乎是 numpy.array_equal 方法。

    【讨论】:

    • 您应该使用更大的数组大小,至少需要一秒钟的时间来编译以提高实验的准确性。
    • 当比较顺序改变时,这是否也会重现?还是每次都重新初始化A和B?这种差异也可以通过 A 和 B 单元的内存缓存来解释。
    • 这些时间之间没有有意义的区别。
    【解决方案4】:

    如果您想检查两个数组是否具有相同的shape AND elements,您应该使用np.array_equal,因为这是文档中推荐的方法。

    在性能方面不要期望任何相等性检查会胜过另一个,因为没有太多空间可以优化comparing two elements。只是为了着想,我还是做了一些测试。

    import numpy as np
    import timeit
    
    A = np.zeros((300, 300, 3))
    B = np.zeros((300, 300, 3))
    C = np.ones((300, 300, 3))
    
    timeit.timeit(stmt='(A==B).all()', setup='from __main__ import A, B', number=10**5)
    timeit.timeit(stmt='np.array_equal(A, B)', setup='from __main__ import A, B, np', number=10**5)
    timeit.timeit(stmt='np.array_equiv(A, B)', setup='from __main__ import A, B, np', number=10**5)
    > 51.5094
    > 52.555
    > 52.761
    

    几乎相等,无需谈论速度。

    (A==B).all() 的行为与以下代码 sn-p 非常相似:

    x = [1,2,3]
    y = [1,2,3]
    print all([x[i]==y[i] for i in range(len(x))])
    > True
    

    【讨论】:

      【解决方案5】:

      通常两个数组会有一些小的数值误差,

      您可以使用numpy.allclose(A,B),而不是(A==B).all()。这将返回一个布尔 True/False

      【讨论】:

        【解决方案6】:

        现在使用np.array_equal。来自文档:

        np.array_equal([1, 2], [1, 2])
        True
        np.array_equal(np.array([1, 2]), np.array([1, 2]))
        True
        np.array_equal([1, 2], [1, 2, 3])
        False
        np.array_equal([1, 2], [1, 4])
        False
        

        【讨论】:

        【解决方案7】:

        在其他答案之上,您现在可以使用断言:

        numpy.testing.assert_array_equal(x, y)
        

        你也有类似的功能如numpy.testing.assert_almost_equal()

        https://numpy.org/doc/stable/reference/generated/numpy.testing.assert_array_equal.html

        【讨论】:

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