使用 ImageJ 循环保存答案

【问题标题】：SaveAs in a loop with ImageJ使用 ImageJ 循环保存
【发布时间】：2015-09-02 03:22:06
【问题描述】：

我是 imageJ 及其宏的新手，我无法从粒子分析中循环保存结果文件。

这是我的代码，由我刚刚在互联网上学到的东西组成，我只是不能在 saveAs 函数中包含 [i]，而且图像的保存不匹配，而我什至还没有尝试保存它...

path1=getDirectory("Mydir");
list=getFileList(path1);
path2=getDirectory("My output dir");
setBatchMode(true);

for(i=0;i<list.length;i++){
    open(path1+list[i]);
    run("8-bit");
    run("Analyze Particles...", "size=0-Infinity circularity=0.00-1.00 show=[Bare Outlines] display clear");
    selectWindow("Results");
    saveAs("Results", path2+"Results.xls");
    close();
} 
setBatchMode(false);
run("Close");

【问题讨论】：

标签： for-loop imagej

【解决方案1】：

要在for 循环的每个循环中保存结果窗口，您可以将计数器变量i 添加到文件名字符串中：

saveAs("Results", path2+"Results" + i + ".xls");

在结果文件名中也包含原始图像文件名可能是个好主意，例如：

saveAs("Results", path2+"Results" + list[i] + ".xls");

注意：我必须在 Analyze Particles... 命令之前添加 setAutoThreshold("Default");，以使您的宏在 Blob 示例图像等示例图像上工作，因为该命令需要阈值/二进制图像。

【讨论】：

谢谢 Jan。它保存了我的第一个“结果”文件，但随后我收到一条警告消息：“似乎该目录（用于保存的目录，path2！）没有 TIF、JPEG、BMP , (...) 文件。”它怎么会在那个文件夹中读取？注意：我确实使用二进制图像。
这是因为我的“保存”目录在我的“进程”目录中。我工作正常！