【问题标题】:Can I save scale settings between startups in ImageJ using start-up macros?我可以使用启动宏在 ImageJ 中保存启动之间的比例设置吗?
【发布时间】:2016-01-10 13:17:27
【问题描述】:

我最近刚刚开始使用 ImageJ(或者更具体的 Fiji)来测量显微镜照片中硅藻壳的大小。使用微米尺度的参考照片设置全局尺度非常简单,然后只需使用线工具来测量我的硅藻。唯一的问题是,每次我启动程序时,我都必须重新设置秤,我宁愿避免额外的麻烦,也避免每次校准有点不同的问题。我找到了启动宏生成器,如果我可以将比例设置为每微米 164.4 像素,我会是一只快乐的河马。不幸的是,当谈到计算机语言时,我是个文盲。谁能帮帮我。

【问题讨论】:

    标签: macros imagej


    【解决方案1】:

    您可以使用macro recorder插件 > 宏 > 记录...)来获取实现该目标所需的代码:

    run("Set Scale...", "distance=164.4 known=1 pixel=1 unit=um global");
    

    如果您打算将其放入您的StartupMacros.txt,请注意该命令至少需要打开一张图片。

    【讨论】:

      【解决方案2】:

      对于在启动时设置比例,Jan 的提示很棒。

      对于你有不同比例的情况(你说你的可能每次都不一样),你可以试试我之前做的这个 FIJI 插件:FIJI Plugins: Microscope Measurement Tools

      此插件可让您保存经常使用的音阶,并通过列出您保存的音阶的弹出窗口应用它们。

      说明会告诉您如何在第一次安装和设置校准文件。

      【讨论】:

      • 仅供参考,有一个较旧的插件提供了类似的功能,称为“显微镜刻度”,但不幸的是,当从 FIJI 菜单编译 jython 插件的能力消失时,它的易用性在某些时候坏了离开。因此,新插件不会对音阶进行硬编码,而是使用文本配置文件。
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