为旧版本编译 R 包“arulesSequence”

Question

我想使用arulessequences 进行序列挖掘。我必须在 Oracle R 发行版 R 3.3.0（最后发布）中使用它，问题是 arulesSequences 包的最后一个版本是 R >= 3.3.2。所以我得到了这个问题的错误：

错误：这是 R 3.3.0，包 arulesSequences 需要 >=3.3.2

所以我决定为旧版本编译源代码。我下载了一个需要 R 3.2.5 或更高版本的旧包。而且我知道这个包依赖于规则。所以我已经安装了它。我使用以下说明来编译 arulesequences 包： 在源目录中我运行这个命令：

R CMD build arulesSequences 该命令的输出是：

c:\rr\arulesSequences_0.2-17>R CMD 构建 arulesSequences
* 检查文件“arulesSequences/DESCRIPTION”...确定
* 准备“arulesSequences”：
* 检查DESCRIPTION元信息...好的
* cleanup_pkg(pkgdir, Log) 中的清理 src 警告：无法在“src”中运行“make clean”
* 检查源代码中的 LF 行尾并生成文件
* 检查空目录或不需要的目录
* 查看是否应添加“数据/数据列表”文件
* 构建 'arulesSequences_0.2-17.tar.gz'

创建了一个名为“arulesSequences_0.2-17.tar.gz”的文件，但是当我如下检查时，我得到以下输出：

c:\rr\arulesSequences_0.2-17\arulesSequences>R CMD 检查 arulesSequences
* 使用日志目录'c:/rr/arulesSequences_0.2-17/arulesSequences/arulesSequences.Rcheck'

• 使用 R 版本 3.4.0 (2017-04-21)
• 使用平台：x86_64-w64-mingw32（64位）
• 使用会话字符集：ISO8859-1
• 正在检查文件“arulesSequences/DESCRIPTION”...确定
• 这是包'arulesSequences'版本'0.2-17'
• 检查包命名空间信息...确定
• 检查包依赖关系...错误包需要但不可用：'arules'

请参阅“编写 R 扩展”中的“描述文件”部分
手册。
* 完成状态：1 个错误

我知道 arules 包已经安装并且我检查了它。似乎构建过程不成功。你有什么想法可以帮助解决这个问题吗？

Answer 1

您必须首先安装 R 的附加构建工具下的 R 的 c/c++ 编译器（称为 gcc）。 为此，在 RStudio 中转到 File->New File ->c++ File。 它将显示以下对话框： 然后点击是。 要在 windows 下编译包，您必须将 repo 设置为 Null 并键入 source。 你可以使用这个命令来做到这一点：

install.packages("SOURCEADDRESS",type="source",repo=null)

正如上面提到的@EugèneAdell，您必须先安装 arules。然后是 arulesequences。

Answer 2

不要构建，而是获取似乎适合您的 R 版本的存档包并安装它们。在我的 Linux 上，这给出了：

wget http://cran.univ-paris1.fr/src/contrib/Archive/arules/arules_1.5-0.tar.gz
R CMD INSTALL $HOME/arules_1.5-0.tar.gz
* installing to library ‘/home/ruser/R-3.2.5/lib64/R/library’
* installing *source* package ‘arules’ ...
...
** testing if installed package can be loaded
* DONE (arules)

wget http://cran.univ-paris1.fr/src/contrib/Archive/arulesSequences/arulesSequences_0.2-17.tar.gz
R CMD INSTALL $HOME/arulesSequences_0.2-17.tar.gz
* installing to library ‘/home/ruser/R-3.2.5/lib64/R/library’
* installing *source* package ‘arulesSequences’ ...
...
** testing if installed package can be loaded
* DONE (arulesSequences)

R
> library(arulesSequences)
Loading required package: arules
Loading required package: Matrix

Attaching package: ‘arules’

也许 arules 的更新版本是可能的，我刚刚从 1.5 系列中取了第一个。