是否可以忽略/丢弃 MPI_Allgather 中接收到的数据？答案

【问题标题】：Is it possible to ignore/throw out received data in MPI_Allgather?是否可以忽略/丢弃 MPI_Allgather 中接收到的数据？
【发布时间】：2012-03-31 02:02:27
【问题描述】：

在 MPI 中，是否可以立即丢弃接收到的数据而不分配缓冲区来保存它？我正在使用 MPI_Allgather 从多个进程收集数据，但在某些时候，一个或多个进程没有要发送的有用数据。

我最初的解决方案是让无用的过程完成。但是，如果一个任务在没有调用 MPI_Allgather 的情况下终止，则其余任务将陷入死锁，因为 MPI_Allgather 阻塞。为了克服这个问题，我将所有进程保留到最后，但发送从未使用过的垃圾数据。

有用的进程会保留一些接收到的数据，但无用的进程不会。我尝试像这样为 recbuf 传递一个空指针：

MPI_Allgather(&sendbuf, 1, MPI_INT, 0, 1, MPI_INT, MPI_COMM_WORLD);

但它没有用。我能做些什么来避免接收或至少存储无用的数据吗？

【问题讨论】：

标签： c++ c mpi parallel-processing

【解决方案1】：

您可以为有用的进程创建一个新组并聚集在该组而不是MPI_COMM_WORLD。

【讨论】：

+1 这是实现仅涉及所有进程的子集的集体通信的正确方法。如果非通信进程仍需要与其他进程同步，则可能还需要屏障。

【解决方案2】：

根据定义，集合是集合，这意味着通信器中的每个进程都必须调用它们。如果您需要对通信器的子集执行集体调用，则必须按照已经建议的那样创建一个新的通信器。

您还可以查看MPI_Allgatherv，看看它是否适合您的应用程序。使用这个集合，您可以指定每个进程将发送多少数据。但是，通信器中的每个进程仍然必须调用MPI_Allgatherv，即使是那些不发送数据的进程。除此要求外，所有进程都必须知道每个进程贡献了多少数据。

最后，MPI 3 很可能会包含稀疏的集合操作，这些操作完全符合您的要求。但就目前而言，新的沟通者可能是最好的方法。

【讨论】：