我想进入一个具有奇点的容器，然后运行 slurm 命令。例如：
singularity shell docker://tensorflow/tensorflow:1.0.0-gpu-py3
然后在其中运行我想要运行我的脚本的脚本：
python tf_test.py
tf_test 的内容是：
import tensorflow as tf
print(tf.random_uniform((3,2)))
我遇到的问题是容器不知道我在 HPC 中或存在 slurm。是否可以在我们进入容器后才运行 slurm 命令？我对使用sbatch 特别感兴趣。使用 srun 然后进入容器是作弊，而不是我想要的。
【问题讨论】：
标签： docker machine-learning containers slurm singularity-container
不确定您正在运行的版本，但这应该适用于 2.4.x 系列。
您可以在容器中安装 slurm，或者如果它安装在您的集群上，例如：
/apps/sched/slurm/[ver]
您可以使用 -B / --bind 选项来绑定挂载它：
singularity shell -B /apps/sched/slurm/[ver] -B /etc/slurm
但是，作业在运行时将不在容器中。要强制这样做，您可以提交一个执行类似以下内容的运行脚本：
singularity exec docker://tensorflow/tensorflow:1.0.0-gpu-py3 python /path/to/tf_test.py
编辑： 一旦你对运行感到满意，IMO 最好从 Docker 源构建一个 Singularity 映像。在定义文件中，设置一个 %runscript 部分，如
%runscript
python "$@"
然后你就可以提交了：
/path/to/imagename.img /path/to/tf_test.py
奇点图像可以像应用程序一样运行，默认情况下它将执行 %runscript 部分中的任何内容。
【讨论】：