【问题标题】:Groups of MPI do not assign correct rank of processorsMPI 组未分配正确的处理器等级
【发布时间】:2015-07-30 05:15:20
【问题描述】:

我有以下 MPI/fortran 代码来创建两组,其中一组 包含处理器总数的前 2/3 和第二个 其中包括其余的 1/3。它编译没有问题但是当我 打印出新排名(在最近创建的组中),只有第二个 组显示正确的排名,第一组中的进程 显示负数。

您对此问题有何评论? 谢谢。

program test

    implicit none
    include "mpif.h"
    integer, allocatable :: rs_use(:),ks_use(:)
    integer numnodes,myid,mpi_err
    integer ijk,new_group,old_group,num_used,used_id
    integer proc_rs,proc_ks
    integer RSPA_COMM_WORLD    !Real Space communicator
    integer KSPA_COMM_WORLD    !Recip. Space communicator

! initialize mpi
    call MPI_INIT( mpi_err )
    call MPI_COMM_SIZE( MPI_COMM_WORLD, numnodes, mpi_err )
    call MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, myid, mpi_err)

    proc_rs = 2*numnodes/3            !Nr. of processors for Real Space
    proc_ks = numnodes - proc_rs      !Nr. of processors for Recip.  Space

    write(6,*) 'processors rs',proc_rs,'ks',proc_ks

! get our old group from MPI_COMM _WORLD
    call MPI_COMM_GROUP(MPI_COMM_WORLD,old_group,mpi_err)

! Real Space group  that will contain 2*N/3 processors
    allocate(rs_use(0:proc_rs-1))
    do ijk=0,proc_rs-1
        rs_use(ijk)=ijk
    enddo
    call MPI_GROUP_INCL(old_group,proc_rs,rs_use,new_group,mpi_err)
! create the new communicator
    call MPI_COMM_CREATE(MPI_COMM_WORLD,new_group,RSPA_COMM_WORLD, mpi_err)
! test to see if I am part of new_group.
    call MPI_GROUP_RANK(new_group,used_id, mpi_err)

! Recip.  Space group  that will contain N/3 processors
    allocate(ks_use(proc_rs:numnodes-1))
    do ijk=proc_rs,numnodes-1
        ks_use(ijk)=ijk
    enddo
    call MPI_GROUP_INCL(old_group,proc_ks,ks_use,new_group,mpi_err)
! create the new communicator
    call MPI_COMM_CREATE(MPI_COMM_WORLD,new_group,KSPA_COMM_WORLD, mpi_err)
! test to see if I am part of new_group.
    call MPI_GROUP_RANK(new_group,used_id, mpi_err)

    if(used_id==0) write(6,*) 'group ',used_id,myid


end program test

【问题讨论】:

  • 您不会测试对 MPI 例程的任何调用是否成功。 allocate 声明也没有成功。为什么我不应该断定其中一个调用会静默失败?
  • 您好,我测试了 allocate 和 MPI 例程,感谢您的建议。但是,我仍然有问题,第一组的 used_id 打印出负数。
  • @innoSPG 有正确答案,但我将提供两个更一般的建议:(1) 在现代 fortran 中,强烈建议您使用 use mpi 而不是include "mpif.h",并让编译器在编译时为您找到潜在问题的整个类。 (2) 在这种情况下,您要将现有通信器划分为两个不重叠的子集,使用 MPI_Comm_split 更容易。

标签: fortran mpi


【解决方案1】:

问题是只有属于该组的进程在该组中有一个 id。您需要做的是仅在适当的进程组中设置new_group,并在将每个进程包含在其新组中后检查新ID。例如,使用临时变量tmp_group 调用MPI_COMM_CREATE 并将其仅分配给组的进程。对于MPI_COMM_CREATE 的第一次调用,请执行以下操作:

call MPI_GROUP_RANK(tmp_group,used_id, mpi_err)
if(myid<proc_rs) new_group = tmp_group

第二次调用MPI_COMM_CREATE,你可以这样做:

call MPI_GROUP_RANK(tmp_group,used_id, mpi_err)
if(myid>=proc_rs) new_group = tmp_group

完成所有这些后,您可以查看所有的新排名:

call MPI_GROUP_RANK(new_group,used_id, mpi_err)

如果您选择在创建组后立即检查组中的排名,请确保仅处理属于该组调用的进程。但这不是一个好主意,因为您可能不会保存 new_group。

【讨论】:

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