使用 matplotlib 运行线程导致 python 崩溃

Question

我的程序有 2 个非常简单的线程：

• 一个用于监听串口
• 一个用于文本用户界面

我还有一个matplotlib animation 在我的main() 中运行。它有一个 scope 类，这是来自 matplotlib 的示例。

当程序开始运行时，它显示了情节并且一切正常。问题是，只要用户输入一个键，程序就会崩溃，python 会以致命错误退出。

ui 线程与matplotlib 和scope 类无关。如果我删除创建绘图的代码，ui 线程没有问题，程序运行顺利。我还注意到我的系统上的matplotlib 使用tkinter 来创建窗口。

您对matplotlib animation 导致问题的原因有任何提示或经验吗？线程不能与matplotlib plot 一起使用吗？

我在Windows7 和Python 2.7 的命令行窗口中运行它。

matplotlib 版本：2.0.2 Tkinter 版本：8.5

错误：

Fatal Python error: GC object already tracked

This application has requested the Runtime to terminate it in an unusual way.
Please contact the application's support team for more information.

或者这个错误：

TclStackFree: incorrect freePtr. Call out of sequence?

This application has requested the Runtime to terminate it in an unusual way.
Please contact the application's support team for more information.

代码：

    import threading
import serial
from matplotlib.lines import Line2D
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.animation as animation

class listner(threading.Thread):

        def __init__(self,port):
            threading.Thread.__init__(self)
            self.sport=None
            self.is_running=True
            self.init_port(port)

        def run(self):
            print ' Reading from Port'
            while self.is_running:
                try:
                    self.sport.read(1)
                except:
                    print 'Error reading port'

        def init_port(self,port):
            print '1'
            if self.sport==None or not self.sport.is_open :
                try:

                    self.sport = serial.Serial(port,115200)
                    self.sport.timeout = 1
                    self.sport.reset_input_buffer()
                    self.sport.reset_output_buffer()
                    self.port_open=True
                except:
                    print "    Port error Listener Initing\n",self.port_open,'\n',self.sport
            else:
                pass

        def process(self):
            pass


class ui(threading.Thread):

        def __init__(self):
            threading.Thread.__init__(self)     
            self.running = True

        def run(self):

            print 'Starting UI:\n'
            while self.running:
                print ' Enter input ''S'':\n'
                user = raw_input()



def main(port):

        listner_thread = None
        try:
            listner_thread = listner(port)
            listner_thread.start();
        except:
            print "Listener Thread Failed To Start"
            return

        ui_thread=None
        try:
            ui_thread = ui()
            ui_thread.start()          
        except:
            print "UI Thread Failed To Start"
            return

        run_charts()



def run_charts():
        fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(2, 1)

        scope1 = Scope(ax1)
        ani1 = animation.FuncAnimation(fig, scope1.update, emit_ch1, interval=10,blit=True)

        scope2 = Scope(ax2)
        ani2 = animation.FuncAnimation(fig, scope2.update, emit_ch2, interval=10,blit=True)

        plt.show()

def emit_ch1():
    yield 0.001

def emit_ch2():
    yield -0.001

class Scope(object):
        def __init__(self, ax, maxt=2, dt=0.02):
            self.ax = ax
            self.dt = dt
            self.maxt = maxt
            self.tdata = [0]
            self.ydata = [0]
            self.line = Line2D(self.tdata, self.ydata)
            self.ax.add_line(self.line)
            self.ax.set_ylim(-.009, 0.009)
            self.ax.set_xlim(0, self.maxt)

        def update(self, y):
            t = self.tdata[-1] + self.dt
            self.tdata.append(t)
            self.ydata.append(y)
            self.line.set_data(self.tdata, self.ydata)
            return self.line,



if __name__ == '__main__':
        main('COM11')

Answer 1

第一个错误“Fatal Python Error:GC object Already Tracked”于 2013 年以“CLOSED WONTFIX”状态关闭，请参阅 Bugzilla 上的 bug report

似乎在 2015 年 [关于 dask] 再次提出时的临时修复是使用此代码use a single thread：

   import dask
   dask.set_options(get=dask.async.get_sync)

但问题实际上在于dataframe.read_csv 问题。

问题是在更高版本的熊猫中eventually solved。如果你升级你的 matplotlib 版本，这个问题很可能也可以通过类似的修复来解决。

希望对你有帮助