使用 awk 解析特定条件答案

【问题标题】：using awk to parse a specific condition使用 awk 解析特定条件
【发布时间】：2015-03-15 01:24:55
【问题描述】：

我正在尝试使用awk来解析多个条件，但在第一个条件下遇到了一些问题。我认为下面的代码很接近，但它没有返回所需的输出。解析规则是：谢谢:)。

NC_ 之后的四个零（并非总是如此）和 . 之前的数字。
克。 ### g.###
c
t

awk -F"[_.>]" 'FNR>1 {X=$4+0;子（X，“”，$ 4）；打印 $2+0, X, X, $4, $5}' OFS="\t" ${id}_position.txt > ${id}_parse.txt

id_position.txt

Input Variant   Errors  Chromosomal Variant Coding Variant(s)
NM_004004.5:c.79G>A     NC_000013.10:g.20763642C>T  NM_004004.5:c.79G>A XM_005266354.1:c.79G>A  XM_005266355.1:c.79G>A  XM_005266356.1:c.79G>A

期望的输出：

13     20763642     20763642     C     T

【问题讨论】：

这看起来与您在此处的其他问题非常相似：stackoverflow.com/questions/29038614/…
是的，但是我稍微修改了脚本并发布了一些数据......如果我做错了，我深表歉意，但我虽然这可能更容易阅读。谢谢你:)。

标签： awk

【解决方案1】：

应该这样做：

awk 'NR==2 {split($2,a,"[_.>]");b=substr(a[4],1,length(a[4]-1));print a[2]+0,b,b,substr(a[4],length(a[4])),a[5]}' OFS="\t" file
13      20763642        20763642        C       T

【讨论】：