使用 grep 或 awk 打印数据列

Question

我有两个文件说(file1.dat, file2.dat)

file1.dat contains a line similar to
     STR       KAPPA2=0 RMAXS=4.2 NDIMIN=0 NOCALC=F IALPHA=0
file2.dat contains 
     class Fe   convergency of s-channel=   0.347E-04
     class Sr   convergency of s-channel=   0.289E-04
     class Bi   convergency of s-channel=   0.111E-04
     class Pt   convergency of s-channel=   0.900E-04

我想获取RMAXS (4.2) 和convergency 的值，然后存储这些值 文件中的值 (say plot), column wise

4.2    0.347E-04
4.2    0.289E-04
4.2    0.111E-04
4.2    0.900E-04

我可以获取单个值（使用 grep 和 awk）但不知道如何将它们存储在 以上格式。

Also is there a way to print the shell variables like `$HOME` or
`$PWD` as the third column in the file (plot).

Answer 1

这是一个简单的 Awk 解决方案。

awk -v h="$HOME" '# From file1.dat, read RMAXS value into r
    NR==FNR { if (sub(/.*RMAXS=/,"")) { sub(/ .*/,""); r = $0; } next }
    # From file2.dat, print final field along with r and h
    /convergency of s-channel=/ { print r, $NF, h }' file1.dat file2.dat >plot

-v var=value 选项允许您从命令行分配任意变量。这里，我们用它来设置h为环境变量HOME的值。

NR 变量跟踪行号，FNR 变量跟踪当前文件中的行号。所以NR==FNR 在处理第一个文件时。如果找到RMAXS=，则提取该值并将其分配给r。如果文件中有其他行，则直接跳过。

如果我们失败了，我们在第二个文件中；如果一行与convergency 正则表达式匹配，我们将打印最后一个字段（NF 计算行上的字段数，默认情况下以空格分隔）以及两个变量的值。

天真的尝试会使用一个 Awk 脚本从第一个文件中提取 RMAXS 的值，并将其作为变量提供给第二个 Awk 脚本。 NR==FNR 技巧允许我们在一个过程中完成所有操作，恕我直言，提高可读性（一旦您了解它的工作原理！）

Answer 2

根据您目前提供的信息。你需要的是echo and grep 看这个例子：

我们有两个文件：f1 和 f2：

kent$  head f*
==> f1 <==
STR       KAPPA2=0 RMAXS=4.2 NDIMIN=0 NOCALC=F IALPHA=0

==> f2 <==
 class Sr   convergency of s-channel=   0.347E-04

现在做这行：

kent$  echo "$(grep -Po '(?<=RMAXS=)[^\s]*' f1)\t$(grep -Po 'channel=\s*\K[^\s]*' f2)\t$PWD" > f3

检查新生成的文件，f3:

kent$  cat f3
4.2    0.347E-04    /tmp/test

这 3 列是 <tab> 分隔的。您可以将其更改为 echo 行中的其他分隔符。

Answer 3

我将假设 file1 中的每个 RMAXS 值对应于 file2 中的相应顺序收敛值，等等：

paste <(grep -oP 'RMAXS=\K\S+' file1.dat) \
      <(grep -oP 'convergency[^=]+=\s*\K\S+' file2.dat) | 
sed "$(printf 's#$#\t%s#' "$HOME")"

<(cmd arg ...) 语法称为process substitiution。您可以将命令管道视为其他命令可以读取或写入的文件。以下是指向paste、sed、grep、perl regular expressions 和 printf 的文档链接