AWS Linux 服务器安装 R 包答案

【问题标题】：AWS Linux Server install R packageAWS Linux 服务器安装 R 包
【发布时间】：2018-06-26 16:43:08
【问题描述】：

我尝试按照本指南在 Amazon Linux 实例上通过 Rstudio Server 安装包“data.table”（和“aws.s3）”： http://stanke.co/category/r/

不幸的是，我收到以下错误消息。我真的不知道还能做什么。

有人可以帮忙吗？我安装了 devtools，并且能够安装其他软件包，例如 xml2、devtools 和 deplyr。

【问题讨论】：

我在这里发布了一个解决方法：stackoverflow.com/questions/48576682/r-and-data-table-on-aws

标签： amazon-web-services rstudio-server install.packages

【解决方案1】：

yum install R-devel

那么你应该可以运行安装命令了。

【讨论】：

【解决方案2】：

基于https://github.com/RcppCore/RcppArmadillo/issues/200，我认为这个问题是由于 g++ 兼容性问题。它也可以解释为什么当我安装 devtools 时它一直给我 [-Wdeprecated-declarations] 所以运行： sudo yum remove gcc72-c++.x86_64 libgcc72.x86_64

【讨论】：

【解决方案3】：

我在 AWS 上遇到了同样的问题，并且已经解决了。您需要先安装 gcc64 和 openmp 共享支持库。

sudo yum install gcc64
sudo yum install libgomp

然后在您的用户主目录下创建一个 .R 文件夹，其中包含一个 Makevars 文件，其内容如下（它将告诉 R 使用哪个编译器）：

CC = /usr/bin/gcc64
CXX = /usr/bin/g++
SHLIB_OPENMP_CFLAGS = -fopenmp

我希望它也对你有用......

【讨论】：

为我工作。谢谢！
恐怕这对我不起作用 - 我应该在哪里创建 .R 文件夹？我已经在我认为应该在的位置（cd ~; mkdir .R）以及存储笔记本本身的 Sagemaker 目录中创建了它...

【解决方案4】：

你需要安装dmlc-core。

【讨论】：

我已经执行了以下操作： sudo yum -y install libcurl-devel openssl-devel sudo yum -y install libxml2 libxml2-devel 但是，问题仍然存在。有什么想法吗？
我对 R 环境了解不够。您的代码的问题是缺少包含文件“omp.h”。该文件是 dmlc-core 库的一部分。
好的，谢谢！我可以提供哪些信息，这可能会有所帮助？