'data' 不是从 'namespace:my_package' 导出的对象

Question

我正在编写一个使用外部数据的函数，如下所示：

首先检查数据是否在data/文件夹中，如果不在则创建data/文件夹，然后从github下载文件；

如果数据已经在data/ 文件夹中，它会读取它并执行计算。

问题是，当我跑步时：

devtools::check()

它返回：

Error: 'data' is not an exported object from 'namespace:my_package'

我应该手动在NAMESPACE 上添加一些东西吗？

一个例子：

my_function <- function(x){
if(file.exists("data/data.csv")){
    my_function_calculation(x = x)
  } else {
    print("Downloading source data...")
    require(RCurl)
    url_base <-
 getURL("https://raw.githubusercontent.com/my_repository/data.csv")
    dir.create(paste0(getwd(),"/data"))
    write.table(url_base,"data/data.csv", sep = ",", quote = FALSE)
    my_function_calculation(x = x)
  }
}

my_function_calculation <- function(x = x){
    data <- NULL
    data <- suppressMessages(fread("data/data.csv"))
    #Here, I use data...
    return(data)
}

Answer 1

有 3 件事需要检查：

1. 文档名称恰当：

#' Name_of_the_data
#'
#' Description_of_the_Data
#'
#' @format A data frame with 10000 rows and 2 variables:
#' \describe{
#'   \item{Col1}{description of Col1}
#'   \item{Col2}{description of Col2}
#' }
data

1. RData 文件在 data/ 文件夹中被适当地命名为导出。

2. RData 文件已加载，名称为 data。

如果文档 (1) 是 A，则 Rdata 文件是 A.RData (2)，但对象（当使用 load() 加载时）被命名为 B- 你会得到这个错误。

Answer 2

我遇到了同样的错误，我可以通过以下方式克服错误。

数据文件位于：data/df.RData
R 文档文件位于：R/df.R

我通过将df.txt 文件导入R 并使用save() 函数创建.RData 文件来创建df.RData 文件。我使用以下代码块创建.RData 文件。

x=read.table("df.txt")
save(x,file="df.RData")

然后在运行 RCMD 检查后，我得到与 df is not an exported object from namespace "package name" 相同的错误。

我已通过将df.RData 文件的变量名称更改为

df=read.table("df.txt")
save(df,file="df.RData")

Answer 3

我将添加另一个陷阱。在 RStudio 中工作 我已经为MyString 分配了一个字符串并保存在我的包项目的数据文件夹中：

save(MyString, file="./data/MyString.RData")

我的./R/data.R 文件包含相关文档：

#' A character string
#'
"MyString"

这行得通。但是您必须每个对象使用一个文件，而不是使用save(X, Y, Z, file="BitsAndPieces.RData") 然后记录BitsAndPieces。如果你这样做，那么你会得到这个问题的错误。我做到了，不用说。

Answer 4

我花了几个小时试图解决这个问题。终于搞定了。

注意事项：

1. 数据文件必须是“rda”类型。 “rds”不起作用。
2. 文件名必须小写。
3. 文档名称中的 NULL 对我不起作用。必须是小写字符串。

一般来说，相同的错误信息似乎是由几件事引起的。检查器不喜欢与数据文件相关的任何内容，它都会发出相同的错误。在这种情况下很难调试。

Answer 5

通常，当data 文件夹中的一个 rda 文件的名称与 R/data.R 中描述的名称不匹配时，就会发生这种情况。

在这种情况下，错误消息中的data 引用是针对data.csv，而不是data 文件夹。您需要在 R 包的 data 文件夹中有 rda 文件。如果你想下载csv，你需要把它们放在inst/extdata。

话虽如此，您可能需要考虑使用tempdir() 将这些文件保存在会话的临时文件夹中。

Answer 6

我在尝试以下操作时遇到了这个“错误：'weekly' 不是从 'namespace:ISLR'' 导出的对象：

library(ISLR)

w <- ISLR::weekly

通过将其更改为以某种方式解决了问题：

w = ISLR::weekly

= 标志在这里起到了重要作用。

Answer 7

当我被错误难住时

Error: 'data' is not an exported object from 'namespace:my_package'

MrFlick 上面的评论救了我。我只是在我的数据文件夹中更改了一个 .rda 文件的名称。我无法让 devtools::document() 重新创建 NAMESPACE 文件。解决方案是将数据重新保存到 .rda 文件中。 （当然我应该记住，当从 .rda 文件加载时，R 对象的名称与 .rda 文件的名称无关，因此重命名 .rda 文件并没有多大作用。）

Answer 8

不需要删除/R文件夹中的data.R，只需要围绕NULL关键字修饰文档如下：

#' Name_of_the_data
#'
#' Description_of_the_Data
#'
#' @format A data frame with 10000 rows and 2 variables:
#' \describe{
#'   \item{Col1}{description of Col1}
#'   \item{Col2}{description of Col2}
#' }
NULL

Answer 9

不可能在每种情况下都相同，但我通过删除 R/ 文件夹中的 data.R 文件解决了这个问题。

data.R 是一个描述包中所有数据的文件。从我的代码的上一个版本开始，我就有了它，它内置了数据，而不是远程（要下载）。 删除文件解决了我的问题。

data.R 示例：

#' Name_of_the_data
#'
#' Description_of_the_Data
#'
#' @format A data frame with 10000 rows and 2 variables:
#' \describe{
#'   \item{Col1}{description of Col1}
#'   \item{Col2}{description of Col2}
#' }
"data_name"