连接具有匹配字符串的 2 个文件中的 2 行答案

【问题标题】：Concatenating 2 lines from 2 files having matching strings连接具有匹配字符串的 2 个文件中的 2 行
【发布时间】：2013-06-07 20:35:49
【问题描述】：

我对 Unix 还很陌生，但是我很想学习它。我有 2 个文件，有些行有一些匹配的子字符串，我想将这些行连接成一行，而其他行保持不变。下面是一个例子..

文件1（fasta文件）：

>292183
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGACAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGGGGCAGCGGGGAGGAAGCTTGCTTTCTCTGCCGGCGACCGG CGCACGGGTGAGT
>551166
GTCGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGATTATCTGCCCCGAGGTGGGGGATAACCCGGGGAAACTCGGGCTAATACCGCATATGACCGTGAGGTCA AAGGGGGGTCGCA

文件 2：

292183  k__Bacteria
551166  k__Bacteria; p__Acidobacteria

想要的输出：

>292183 k__Bacteria
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGACAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGGGGCAGCGGGGAGGAAGCTTGCTTTCTCTGCCGGCGACCGG CGCACGGGTGAGT
>551166 k__Bacteria; p__Acidobacteria
GTCGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGATTATCTGCCCCGAGGTGGGGGATAACCCGGGGAAACTCGGGCTAATACCGCATATGACCGTGAGGTCA AAGGGGGGTCGCA

为此我尝试使用 awk 和 perl，但我从未将它们放在一个文件中..

感谢您的帮助，此致， M

【问题讨论】：

This会帮你解决。

标签： string fasta

【解决方案1】：

sed 's/\([0-9]*\).*/s.\1.&./' File_2 | sed -f- File_1

【讨论】：