软件版本：
Matlab R2012a x64
Modelsim SE-64 10.2c
安装好以上版本的软件后，不用做其他设置，直接进行下面的步骤。如果matlab使用到S-function函数的话，需要安装和设置相应编译器等，在此不再详细描述。
操作步骤
1. 在matlab工作空间中输入cosimWizard，回车后弹出如下对话框：
如上图，如果正确安装了Modelsim软件，Matlab会自动识别出，请确认上面红色方框中的选择和图中一致。
2. 点击Next后，弹出如下对话框：
点击上图中Add按钮，将工程中的HDL文件添加进来，请注意工程文件中的顺序需要仔细考虑，如果次序错误，可能导致编译通不过（对于我们的工程需要先添加xxx.vhd，然后再添加其他文件，因为此文件中主要定义了一些常量和数据类型，需要被其他文件调用）。添加文件后的界面如下：
点击Next按钮后，会显示如下对话框：
再次点击Next，Status窗口中会显示“CompilingHDL files. Please wait ...”，matlab会对添加进去的文件进行编译（当然是调用了modelsim进行编译），如果没有任何问题会直接进入下一步，如果有问题，Status窗口会给出提示，返回去修改正确后重新按照上面的步骤操作即可。
3. 正确编译后，matlab会进入下一步，显示如下对话框：
在红色圈出的编译框中输入仿真的顶层模块名字xxx，其他不用更改，输入后点击Next按钮，matlab会弹出一个DOS窗口，进行一些文件生成和操作，不用管，完成后DOS窗口会自动关闭。
4. 然后会进入下一个步骤，设置输入输出端口。这里需要注意的，如果有时钟和复位信号的话，而且这两个信号在simulink工作空间中不单独给输入信号，就需要在此进行单独设置，设置后生成的仿真模块不在包含这两个引脚，但是会依据设置的情况内部直接给定激励。如下图，在此我们将clk_sys_s设置为时钟信号，并在随后弹出的对话框中对其进行设置。复位信号rst_sys我们在simulink中给出激励，在此不再进行设置。
5. 点击上图Next后进入下一步，设置输出信号的采样周期，在此我们将输出信号的采样周期设置为xxx（s），如下图：
需要注意，此处的采样周期需要填写数字，单位s，填写工作空间中定义好的变量名字有时会出错。
6. 点击Next按钮后，进入下一步，设置系统时钟信号，在此我们将系统时钟周期设置为xxxns，请注意时间的单位需要在下拉框中单独设置。如下图：
7. 点击Next按钮，进入下一步，如下图：
8. 上图中不用进行任何设置，直接点击Next按钮，进入下一步，如下图：
9. 上图中依然不用做任何设置，直接点Finish完成设置。完成后matlab会自动新建一个simulink模型文件，并在里面包含如下图所示三个文件。其中左边的一个是模型对应的接口文件；右上方的是模型的编译快捷方式，双击即可自动调用modelsim命令，完成模型对应的所有HDL文件的自动编译；右下方的是启动仿真器的快捷方式，双击即可自动启动modelsim，并完成simulink和modelsim的链接。可以将此三个文件拷贝到搭建好的simulink模型中即可使用。
10. 需要补充说明一点的是，正常情况下到上面第9步就可以结束了，但是因为我们的系统时钟周期为xx5ns，为奇数，在仿真时，时钟的占空比是50%，会产生带小数点的高电平和低电平周期，影响仿真速度，且容易出问题，我们需要双击上图中的matlab模块，对其进行手动修改。双击后弹出如下对话框：
选择Simulation选项卡，如下图
将图中的xxx2.5改为xxx3即可，如下图
点击Apply按钮和OK按钮即可。
上文用到的图，均因本人从事的是商业项目，不便透漏与项目有关的信息，因此涂抹掉了与项目相关的部分信息，如有不明白的，可以留言或发邮件，我会尽量全部答复。