【问题标题】:Alignement sequence to existing profile与现有配置文件的对齐顺序
【发布时间】:2026-01-16 15:30:01
【问题描述】:

我想问一下是否有可能使用 biojava 添加序列来退出配置文件对齐?我的意思是我想保持我现有的个人资料稳定。如果我添加新序列进行对齐,如果配置文件中出现间隙,它将贯穿整个列 - 这是我想要得到的。

【问题讨论】:

  • 你应该问biostars.org
  • 您指的是哪种配置文件格式?我知道几个
  • 什么是“个人资料格式”?我使用 biojava 进行对齐(更准确的 MSA 使用 getMultipleSequenceAlignment() 方法。我收到配置文件,现在我想将配置文件与序列对齐。

标签: bioinformatics biojava


【解决方案1】:

您可以在https://mafft.cbrc.jp/alignment/server/add.html 使用“MAFFT --add”网络服务器

【讨论】: